SCENARIO 21 旧敌
在法鲁赞利亚城，埃赞尔正和魔族打得不可开交。而西古马他们即将接近法鲁赞利亚时，却又遭到欧米加的截击。玛丽安蒂尔认出正是欧米加袭击他们的村庄，并将她和马库雷送往研究所。而欧米加似乎对西古马怨念颇深，坚持要打败他。这一场很简单的战役，即没有什么地形限制，亦没有让人头痛的NPC。第3回合时，敌飞兵会出现在地图下端。
此时，埃赞尔已经找到圣剑兰古莉莎，并全速撤出法鲁赞利亚城。
SCENARIO 22 魔窟
在输送用飞空艇前，埃赞尔让部下将圣剑送至雷因法路斯处，自己则留下搜索魔剑阿鲁哈萨托。西古马等人抵达远征军阵营，与杰茜卡回合。相互交换情报后，西古马的小部队前去突袭法鲁赞利亚城。
敌人的首领依然是死人使古洛布，而且他还会令一度被击倒的魔物复活，因此要准备打持久战。我军可以分三路进攻，左右两路不妨交予布琳达和克拉蕾特，中央则是西古马、玛丽安蒂尔和阿尔弗列特。因为中央有支死灵部队异常强劲，最好与其保持一段距离，然后让加强攻击力的弓兵将之射杀。
辛辛苦苦打了一场战役后却一无所获，古洛布再度逃脱，而圣剑和魔剑也没能到手。众人出得法鲁赞利亚城，见到韦拉玖和埃里克，说从战败的魔族口中得知阿鲁哈萨托在加艾鲁手中，而西古马想起欧米加曾说过要拖延时间之类的话，便猜测兰古莉莎是被埃赞尔夺走了。就在此时，基尔莫亚不知从哪里搬来了魔动巨兵，并向法鲁赞利亚城发射魔动炮，企图将西古马他们一网打尽！所幸第一炮打偏了，接下来玛娜（マナ，由植物产生的星球生命能量）能量填充尚需一段时间，发射第二炮需要一小时。
SCENARIO 23 巨兵
正当大家商议乘魔动炮填充能量时，尽快将其摧毁。这时，埃里克终于忍不住承认他是基尔莫亚安插的间谍，因为基尔莫亚对他下药，如果不定期服用解药，就会发狂而死。提供萨尔拉斯军行军路线、烧毁飞空艇等事皆其所为，现在他见基尔莫亚根本不管他的死活，且解药也用完了，便孤身撞向正在发射的魔动炮口以死来赎罪！
这是一场强攻战役，敌人固守在小小的堡垒中，基尔莫亚及其身边两位僧侣皆带着弓兵和炮车，堡垒门口则有队枪兵以及魔动巨兵把守，外面有两队骑兵左右分布。除了那两队骑兵会主动攻击外，其余部队一直是原地待机的，而那个魔动巨兵会在自己周围放射大范围的火焰魔法，不过却是敌我不分地“通杀”，因此还是对我军比较有利，可以让玛丽安蒂尔的妖精不断作回复。第3回合时，克菲尔团长的飞兵部队出现在右下角，好在飞兵的判断力低，可以安插一个部队在附近等候其出现，然后先下手为强。最后进攻基尔莫亚的本阵时，让防御力高的枪兵部队打头阵，飞兵在其后突击，并让玛丽安蒂尔不时回复即可。
战斗结束后，克拉蕾特抱着濒死的埃里克痛哭，埃里克祝愿克拉蕾特完成自己的理想，并认为那实在是非常伟大的构想，然后撒手归去……（西古马想必很高兴，可以少了个情敌。）在连邦王城地下牢，艾米莉要求见被囚的兰方特元帅，遭到守卫的阻拦并和其争执了起来。就在这时，兰狄乌斯从后面偷偷潜入牢中将兰方特救了出来。深山中，韦拉玖接到欧米加故意透露给他们的情报，埋伏在此等候运送圣剑的飞空艇，并用魔动炮将其击落。另一方面，连邦王城内宰相拉塞尔接到兰方特逃狱的报告，似乎并不放在心上。
SCENARIO 24 争夺
数日后，克拉蕾特在卡尔萨斯王城宣布国民为政的制度就此开始了。接着，韦拉玖前来告知载有圣剑的飞空艇现在坠落于伊雷斯大陆的深山中，必须抢在雷因法路斯之前找到它，这一任务又落到西古马他们身上，至于韦拉玖则去打探魔剑的下落。
兰狄乌斯和兰方特在前往卡高西斯王国的途中，后者担心自己的逃狱会给卡高西斯王国带来麻烦，兰狄乌斯却说威拉提督对此早有安排。但是，兰方特并不想就此逃亡，他想起管家说自从其兄长死后，父亲就对自己疏远了，兰方特想要找出其原因，兰狄乌斯亦同意帮忙。
输送用飞空艇坠落在伊雷斯大陆东北部马尔加山中，西古马等人乘着韦拉玖提供的飞空艇赶到当地时，发现欧米加也在那里积极地寻找兰古莉莎，一场争夺战就此展开。本话的胜利条件是敌全灭抑或拿到圣剑的人抵达地图下端，失败条件是圣剑被夺且该敌人抵达地图上端。货舱中一共有十间屋子需要调查，其中除了圣剑外还有不少宝物，兰古莉莎则在左边从上往下数第2间屋子内。如果被敌人先夺得圣剑的话，就要马上追击此部队。反之，我方取得圣剑的人亦会遭到敌人的集中攻击，不过大可利用这一点将敌人引诱到你的包围阵中。
战斗结束后，雷因法路斯率领着克利姆索骑士出现，并要西古马交出圣剑。布琳达一见他就火大，说要讨回其杀害她双亲、毁掉她村庄之仇。这时，士兵报告坠落的飞空艇魔动炉起火，有即将爆炸的危险，而且里面尚有许多人未逃脱。雷因法路斯听后，似乎十分关心那些人的安全，急忙赶去救险，布琳达亦紧追其后。众人不知如何是好时，韦拉玖赶来，他了解情况后让西古马他们先行离开，由他负责将布琳达追回来。在飞空艇机首部，雷因法路斯将其他人员全部疏散后，布琳达追上来要与他在这魔动炉的爆炸中同归于尽。万不得以之下，雷因法路斯将布琳达击昏，交给随后赶来的韦拉玖，翩然而去。
昏迷中的布琳达梦见昔日的情景，她从山中回雷库里奥村（レクリオ）后却发现尸横遍地，邻村高塔尔（ゴタ－ル）的村长因雷库里奥的大坝决堤、造成洪水泛滥故赶过来看个究竟，却不料见到这幅惨景。其中有一尚未断气的少妇将怀中幸存的孩子（即Ⅳ代主角兰狄乌斯）以及贤者水晶交给高塔尔村村长，并叮嘱千万不能将那水晶给任何人……
SCENARIO 25 时限
布琳达醒来后，在众人的追问下，韦拉玖说明他们的来历。远在数千年以前，古代魔导王国克利姆索尼亚时代，分为支配阶级和被称为克利姆索兰达的劳动阶级。那时魔导技术异常发达，人们利用其力量制造出许多高科技的机械，但是两级分化却异常严重，支配阶级居住在赤之月克利姆索上，劳动阶级则在其统治下苦不堪言，而且还时时受到魔族的威胁，最终两阶级间的大战爆发了。战争以支配阶级的失败而告终，但是劳动阶级亦付出相当大的代价，世界一片荒芜，繁荣的魔导王国就此覆灭了。然而，人们所期盼的和平并没有到来。围绕着地球超椭圆轨道上转动的赤之月克利姆索，每200年接近此星球一次，此时两星球散发的能量磁场相互影响，促进混沌之门的活发化，混沌之神卡奥斯从沉睡中惊醒，打开混沌之门将大量的魔族送至地上世界，战乱由此不断……西古马现在所持有的圣剑兰古莉莎，其前身乃昔日大战中劳动阶级制造出的破邪之剑，可惜此破邪之剑并非完成品。不过，成为圣剑兰古莉莎并由光辉之末裔拥有后的破邪之剑，却能发挥出令人意想不到的新力量。至于真正的破邪之剑，现在被称为阿鲁哈萨托，成为与兰古莉莎对立的魔剑，并且已是魔族中黑暗王子伯赞鲁的象征。魔剑阿鲁哈萨托原本的作用已渐渐为人淡忘，但身为昔日劳动阶级克利姆索兰达后裔的韦拉玖、布琳达他们却不会忘记，真破邪之剑那令人恐怖、绝望的作用棗开启最终兵器的钥匙！因此，韦拉玖他们才会千方百计想要夺得圣剑和魔剑，如果此剑落入知情且具有极大野心的人手中，后果将不堪设想！至于雷因法路斯，乃是200年前赤之月克利姆索接近时降落于此、支配阶级克利姆索的王子！正是他先是欺骗了布琳达的感情，然后杀害了全村的人并让洪水决堤……
韦拉玖将他们的来历、目的一一和盘托出，然后告诉众人他们在艾路萨利亚大陆期间，伊雷斯所发生的事情。阿尔弗列特一听三国同盟之事，立刻拜托大家帮助他去说服被雷因法路斯利用的哥哥阿尔维斯。于是，西古马他们向雷诺路兹地方进发。
兰方特和兰狄乌斯走在通往雷诺路兹地方的山道上，却遭到高鲁多利的阻拦（还记得这位被威拉提督炒鱿鱼的老兄吗？打从“？3 对战”在游戏机房大战一场后，很久没有见到他了）。据高鲁多利所言，他现在是受雇于三国同盟，雷因法路斯的参谋塞洛派他来炸毁通往雷诺路兹的山洞。双方一言不合立刻大打出手，此时西古马一行也赶到，便要在20回合内击败高鲁多利。虽然兰方特和兰狄乌斯距离高鲁多利不远，但并不能靠他们，事实上这两人收拾前来攻击他们的枪、骑兵部队已经很吃力了，而且他们还会特意等西古马他们上山后再攻击。（为什么不可以沿用Ⅳ代的记录呢？如此一来又可以用自己培养的超强兰狄乌斯和兰方特来欺负弱小啦！）说回正题，我军可以兵分两路进攻：走西方宽阔的山道，虽然绕远路但敌人较少且能与兰狄乌斯他们回合，派遣阿尔弗列特和布琳达比较方便；东方的山道路程虽短但地形较狭窄，西古马和玛丽安蒂尔一进攻、一援护，再加上不受地形限制的克拉蕾特在一旁助攻，可以很快解决拦道的敌人。
战斗结束后，众人相互介绍，因为目的一致，故兰方特加入队伍同行，兰狄乌斯则回卡高西斯王国向威拉提督说明情况。
