SCENARIO 10 容疑
在连邦王城，萝珊茜尔女王（ロ－ゼンシル）接见兰方特，并任他为元帅，艾米莉亦升为将军。另一方面，雷因法路斯让欧米加去抓西古马，至于埃赞尔则另有重大的任务。
西古马一行终于来到了艾路萨利亚大陆，马库雷因曾从杰茜卡口中听说过巴尔迪亚（バルディア，Ⅰ代主角雷狄的王国，杰茜卡从千年前一直侍奉该王族直至其灭亡）这一地名，所以他就先独自一人前往该处。西古马他们在港町中寻找杰茜卡与克拉蕾特时，正巧看见她们与卡尔萨斯帝国（カルサス，Ⅰ代黑骑士兰斯与飞兵娜姆建立的王国）的士兵争执着什么。仔细一听，原来克拉蕾特是卡尔萨斯帝国的公主，但却是杀害皇帝的共犯。更奇怪的事还在后头，当卡尔萨斯军看到西古马时，竟然说他就是杀害皇帝的凶手！而且原本是帝国近卫骑士团长！当然西古马本人是没有一点记忆的，拉姆达则认为或许他的来历和自己一样，只是失去了以前的记忆而已。
和上一场战斗相同，今次依然要救杰茜卡和克拉蕾特，不同的是敌人会一窝蜂地去攻击她俩，情况比较危急。因此，打一开始，我军就要全力去支援克拉蕾特她们。阿尔弗列特的枪兵部队可以封住上方通路，截击西北方的骑兵。当敌人被消灭得差不多时，其援军于右上角出现，那便是库伊多侯爵（クエイド）的骑兵队，他说大臣基尔莫亚（ギルモア）已经成为卡尔萨斯帝国的新皇帝。这家伙的位置就在杰茜卡旁边，因此必须先发制人抑或调支枪兵部队拦在杰茜卡前面。
赶走了库伊多侯爵，克拉蕾特说明一切情况：四年前其父皇被近卫骑士团长所杀，为了追击凶手克拉蕾特来到伊雷斯大陆，就在三年前她终于手刃仇人，但是现在的西古马却和三年前一模一样。拉姆达认为西古马是被克隆的，至于原本的那位近卫骑士团长乃利古里亚地方（リグリア，听到这一名字各位是否想起了什么吗？）领主埃基鲁公爵（エギル）的儿子。接着克拉蕾特请求众人能否帮助她复国，杰茜卡首先拒绝，她认为克拉蕾特现在根本不明白自己要做什么仅仅是空谈而已。西古马他们则答应其要求，条件是要克拉蕾特帮助他们从魔物手中夺回二剑。
SCENARIO 11 狩猎
在伊雷斯大陆，兰方特去拜访父亲，但是兰贝尔德却不愿见自己的儿子。对父亲现在奇怪的态度，兰方特百思不得其解，最后总算是从管家马斯达松（マスタ－ソン）口中了解到自从哥哥克利方特（クリフォ－ド）死亡后，父亲整个人就变了。
魔族的根据地法鲁赞利亚城（ヴェルゼリア）内，魔将军加艾鲁将圣剑兰古莉莎交给死人使古洛布（グロブ，又是一个Ⅲ代中曾出场过的家伙），至于魔剑阿鲁哈萨托他则保留着，并说要去寻找摧毁圣剑的方法并提升魔剑的能力。
为了帮助克拉蕾特夺回王位，众人前往萨尔拉斯领，寻求其领主雷纳多（レナ－ド）的帮助。在经过奥特兰特湖的堡垒时，正撞见一群平民遭受帝国徵税官的追杀，路见不平自然是要拔刀相助喽。战斗开始时，会要玩者决定让平民们直接通过堡垒抑或绕道而行，笔者是选择了前一个方案。因为我军通往堡垒的桥被收起，所以要让飞兵的克拉蕾特去开启上侧碉堡的开关将桥放下。不过在这两个碉堡上有两队魔法师及弓箭手，必须先要突袭一队魔法师再去开机关。第8回合，敌飞兵援军于左上角、库伊多侯爵则在右下角出现。
再度击退库伊多侯爵，众人平安抵达萨尔拉斯领。但是，雷纳多公爵告诉他们，新皇帝基尔莫亚放任贵族对平民的剥削，充分收揽了贵族们。而克拉蕾特作为公主却离开自己的国家四年之久，现在突然回来，没有什么具体的计划就要求雷纳多援助她，完全是过于天真地纸上谈兵。
此时的伊雷斯大陆也不太平，雷因法路斯联合了撒萨兰多领主兰贝尔德、雷诺路兹领主阿尔维斯，组成三国同盟讨伐现连邦王国。
SCENARIO 12 强要
静夜中西古马一人来到河边，想起自己究竟是谁这一问题，先前研究所出现的第三素体欧米加突然来到他面前，告诉他的过去。四年前，西古马从艾路萨利亚大陆来到伊雷斯大陆，拥有寂寞眼神的他无处可去而被基扎洛夫收留成为其护卫。西古马的出现，威胁到原本亦是基扎洛夫贴身护卫的欧米加的地位，两人相互间一直争斗着。直到三年前，有一少女从艾路萨利亚大陆追踪西古马而来，西古马竟然毫不抵抗地任由她将利剑刺入自己的心脏。基扎洛夫将西古马的尸体运到魔导研究所改造，结果令其复活，代价是以前的记忆全部丧失了……
次日，众人来到崖之町，问及克拉蕾特接下来去哪儿时，她很不情愿地说去她的未婚夫埃里克（エリック）处，布琳达刚想责备她，却见村那边又有事发生。原来该村交不出税，徵税官便将其物资全部夺走，还杀死了阻止他们的村民！
这一战的胜利条件是敌全灭，不过我想各位是不会放过一个敌人的吧？敌军的行进路线是一直往右逃，通过右下的木桥后即离开版图，而靠左边的两只部队会主动上前迎敌。因此我军要兵分两路，让阿尔弗列特和克拉蕾特直接往右行绕到右下木桥前堵住敌人的退路，剩下三支部队先消灭迎击部队，然后从后面包抄敌人。
战斗结束后，出乎众人意料之外，村民们不仅没有感谢他们的相救之恩，反而责怪他们多管闲事惹怒了帝国军，害怕帝国军报复的村民们打算离开自己的村庄。茫然不知所措的克拉蕾特又听到布琳达对她的指责后，哭着离开。西古马追上克拉蕾特安慰她，并告诉她自己并非其杀父仇人的克隆体而是本人。最后，克拉蕾特破涕为笑，她终于醒悟并为自己国家的将来好好地考虑。她觉得光是夺回王位并不能从根本上改变，必须要让人民有自主的意识，要取消贵族，让百姓自己来管理自己的国家。克拉蕾特将这一想法对大家一说，众人齐声叫好，于是再折回去找雷纳多公爵商谈。在连邦王城，兰方特从艾米莉处得知三国同盟反乱的消息，虽然自己的父亲也在其列，但兰方特现在的立场唯有发兵讨伐他们了。
SCENARIO 13 袭击
布琳达的伙伴韦拉玖也得知三国同盟反乱一事，他便和女佣兵们计划帮助连邦军一方。再说克拉蕾特折回去见雷纳多公爵，将自己的想法告诉他。那就是采取议会制，即由国民代表组成下议院，提交法案；贵族议员组成上议院，审议下议院的法案。当然议员是要由国民来选，而世袭的国王自然也不再有绝对的统治权了。雷纳多公爵对克拉蕾特的想法大感佩服，决定尽全力帮助她进行改革，并出兵讨伐新皇帝基尔莫亚。首先，不但要赶基尔莫亚下台，还得说服民众让他们知道今后可以自己掌握自己的国家。为此，众人前往关押政治犯的盖亚纳监狱。
此番战役敌军初期配置不是很强，我军分东、南、西三方包抄盖亚纳监狱，将敌人困死在其中，一个也不能漏掉。待敌全灭或第10回合时，其主力部队方登场。敌指挥官依然是库伊多侯爵，亦是分布在东、南、西三方。西方是一队飞兵、南方乃一队僧兵和一队枪兵、东方是库伊多本队及步兵。因此，我军配置基本上是布琳达和西古马负责西南面，克拉蕾特和阿尔弗列特负责东南方，拉姆达于中央援护。另外，当库伊多出现后，他会打开监狱内各牢房的门，并下令杀死其中的囚犯。如果此时你已经将整个监狱控制在我军手中，那么就让囚犯们在原地待机吧。
战斗结束后，克拉蕾特将建立新制度的方案向囚犯说明，让他们四处去说得民众。接着，克拉蕾特要至光之大神殿艾斯特路，寻求大司教的支持。然而，此时传令兵前来报告，基尔莫亚获知反乱后派出10倍的军力讨伐萨尔拉斯军，3日后两军将正式交锋。萨尔拉斯军的情况显然十分危急，但西古马他们却来不急赶回去，布琳达便说她有办法但条件是事件过后要克拉蕾特把圣剑交给她。
SCENARIO 14 穿孔
布琳达找到也来到艾路萨利亚大陆的韦拉玖，将现在西古马他们的情况说明之后，问有何武器可以给她，韦拉玖便将古代遗产之一飞空艇交于她，同时千叮万嘱必须小心使用，否则其魔动炉爆炸的话后果不堪设想。此时的萨尔拉斯军发现已被大队的飞兵部队包围，显然敌人是在等候主力部队的到来，并在空中监视萨尔拉斯军。雷纳多计划乘黑夜逃出包围圈，因为鸟类大都是夜盲（这点本小姐深有感触，所以晚上基本上足不出户）。
西古马等人乘坐着布琳达借来的飞空艇，火速赶至战域上空与敌飞兵展开一场空战。因为敌人都是飞兵，所以我军的部队编制应以防御性的枪兵及远程攻击的弓箭手为主，而克拉蕾特必须给她配置对空飞兵。本战场基本分为上下两段，下段敌军有三支部队，派遣西古马和布琳达即可应付；上段的四支部队则交由其余三人，不过其中敌飞兵团长克菲尔（クフィ－ル）非常强劲，阿尔弗列特决非其敌手，唯有克拉蕾特的对空飞兵能克制他。另外，上段的另一支部队的指挥官埃里克（エリック）乃克拉蕾特的未婚夫，当两人靠近时埃里克会被克拉蕾特说得，不过NPC的他是不会主动进攻的。这次战役基本上是在敌人攻击范围外静侯其到来，然后一击必杀。
消灭了飞兵部队后，我军抢占了制空权，替萨尔拉斯军解围。接下来接是要突袭敌人的本队了，失去飞兵联系的敌军必定在指挥上出现混乱，现在正是大好时机。至于“弃暗投明”的埃里克则担任萨尔拉斯军与西古马他们之间的联络兵。
