基尼阿斯的MA有九千HP，现在就是大家秀必杀技的时候了，闪光高达的黄金指剑，X高达的月光炮，Z高达的突击……别忘了最后一击要让西罗和爱娜来，击倒基尼阿斯后他会复活并且离去，原来他在MA身上运用了ULTIMATE高达的细胞，所以是会无限再生的。
过关后，雷比尔将军认为一定要消灭挑起这场战争的源头--吉恩军总帅吉伦?扎比，而夏亚也有相同的想法，所以他愿意让新吉恩军和AA舰队共同作战，并且还将自己的战舰送于AA队，此时可以决定是否让夏亚担任舰长，选第一项是让夏亚担任舰长，第二项是让西拿普斯舰长来担任。
第十九关：宇宙要塞阿?保阿?库?Sunset at Zeon
战斗开始前，吉伦的父亲迪金公王想和雷比尔将军议和，而吉伦却已经把卫星炮对准了父亲的舰队……迪金公王和雷比尔将军都葬身在闪光中……
AA舰队来到了吉恩军最后的阵地--宇宙要塞阿?保阿?库，而吉伦也准备好了盛大的欢迎式，而卡特也在其中。敌人分布在三个方向，我方只要让一队去攻击上方的敌人，其余的由中路进攻就可以了。白狼和红色闪电被打倒后都会再复活一次，而西玛被打倒后会撤退。让宏将卡特的HP减到三分之二以下时会发生剧情，卡特又会补满HP，再用宏将他击倒就会有对话，宏没有给予卡特最后一击，而是说服卡特不要再互相争斗而应该去面对真正的敌人。全灭了地图上的敌人后，吉恩军总帅吉伦亲自出马，而且基尼阿斯也在场，但基尼阿斯却因为吉伦曾经下令中止他的阿布萨拉斯开发计划而记恨着吉伦，随后基尼阿斯就将吉恩军舰队消灭。福罗斯特出现后想要将他们认为已经无用的吉伦消灭时基尼阿斯却朝他们开火了，数次对着自己的同伴开火的两兄弟也尝到了被同伴背叛的滋味。
グロムリン一击将阿?保阿?库打成两半。面对拥有如此强大火力和无限再生能力的敌人，众人都感到十分担心，而J博士却鼓励大家说，无论它能怎样再生，只要我们不停地攻击，总能将它完全消灭的，于是众人重新拾起信心准备最后一战。刚才在战场中消失的卡特也来要求加入，我军又添了一份强大的战力。
最终关：狂妄与执着一同结束的时候?The end of ambition
终于来到最终关了，一开始迎接我们的是西玛舰队，全部消灭后就是基尼阿斯本人登场的，他带的部队实力较强，都是大型MA和能防御远程攻击的MD，玩家最好先消灭这些敌人后再专心和基尼阿斯交战。基尼阿斯的ID能大幅增强他的能力，而且还能复活两次，第二次复活后卡修博士会出现，他会告诉我们如何才能打败基尼阿斯，原来在グロムリン身上的ULTIMATE细胞是不完全的，它是根据操纵者的意志来增强机体的能力的，只要以高过基尼阿斯的战斗意志来攻击的话，就能让ULTIMATE细胞停止活动。然后只要让多蒙攻击基尼阿斯就可以引发剧情，在闪光高达的一击下，グロムリン?フォズィル的再生机能完全失效了，集合所有的力量进行最后一次攻击吧。最后一次击倒グロムリン?フォズィル后它的外部武装脱落，露出了里面的グロムリン，最后再将其击破，战争结束了，世界清静了，基尼阿斯也在火光中化为灰烬……
一年战争结束，吉恩公国改名为吉恩共和国，PLANT也重回联邦军管理之下，但是故事还是没有完全结束，我们的独立舰队被任命去扫讨吉恩和OZ的残党，杰库斯正准备要进行地球肃清行动，还有很多的事等着玩家去解决呢……
通关后可以接记录继续玩，不过现在只能索敌，隐藏关也会在索敌战斗之后出现，那么，继续奋战吧各位！
