OK任务完成，炎山来电，虽然破坏了控制器，然而BLUES…………炎山请求见到BLUES的话马上将他消灭，热斗则劝炎山不要往坏处想…………
废话少说，马上去ウラインターネット。途中エンド4区有个试练的NAVI，与他可以和非常强力的火病毒战斗，添加水芯片打吧，打完后知道他们一共有5个。在这里还会见到一个，如果装备了ファーストバリア的话战斗会非常简单。
一路来到ウラインターネット4区上次打暗黑BLUES那里，洛克人发现了机关，可是洛克炮无法破坏，BLUES出现而且帮洛克人将其破坏？？？不过BLUES还是受着控制要将洛克人置于死地，メディ赶来救下洛克人，好在另外一个叫カーネル的NAVI出现来救BLUES，最后由洛克人将控制BLUES的暗黑魂清楚…………
事件过后获得BLUES的魂。
回到基地，炎山恢复了领导，准备明天出发了，回家后和妈妈对话获得资料磁盘，并且妈妈再次为热斗祝福。但是我们的任务还没完，根据提示来到科学省，在了解到过去关于心之网络的事件后可以PLUG OUT了（注意回来这里的话可以在桌面找到RM 1MB）
可以回去睡觉了，等待明天的最终决战吧！
最终章
准备离开家了，先和妈妈告别，然后到日暮店口，再和好朋友们告别后坐直升飞机来到了富士山的敌总部，进去后查里自告奋勇先进去，结果不久后和大家失去了联系。
来到2层水管那里可以PLUG IN进去后获得HPメモリ
从2层进去见到两道门，炎山将小队分开，并且给热斗芯片デルタレイエジ Z，第一枚GIGA芯片！墙壁的黑板可以PLUG IN，那里是通往ウラインターネット的路。
进右边的门，发现里面是暗黑芯片制造厂，剧情过后来到这里可以PLUG IN，并且获得暗黑芯片ダークサークル R。出来后前进发现路被挡，和マグネットマン一起PLUG IN吧。途中按SELECT可以换人，注意这里不能停留过长，否则会受伤。首先由マグネットマン去右边那里踩机关，洛克人则往左边走踩机关。
マグネットマン接下来行动，右边获得メガキャノン F，前进可到下一机关，
洛克人往前左方前进获得HPメモリ，去右边踩机关，マグネットマン再去左边踩机关，这样一来就能打BOSS了。
打败BOSS，他居然放出黑洞要吸走洛克人！危急时刻マグネットマン赶来救出洛克人但自己却被吸走……………………
洛克人安全PLUG OUT，热斗心理也不好受，便去安慰テスラ，之后来到LV2层，这次只见到一个障碍机器，准备PLUG IN的时候发现还有一个机器，还好查里赶到，PLUG IN吧。
首先由ジャイロマン去右边踩机关，洛克人左边获得RM 3MB，右边可以踩机关，ジャイロマン左边走获得部件オイルボディ，并前进踩下一个机关，洛克人这次路比较远，踩下蓝色机关可以让ジャイロマン前进
ジャイロマン上去踩机关。
BOSS战了，结果战斗之前BOSS就将ジャイロマン用黑洞吸走，再次失去伙伴的洛克人愤怒置极，开战！
战斗完毕后PLUG OUT，继续前往LV3层。再次见到障碍。这次由3人合作，ナパームマン破坏两个大X门后，サーチマン则解电子锁。右边的按钮サーチマン不能踩，必须要洛克人踩，左边有个HPメモリ由洛克人去拿，之后回到地一个机关。ナパームマン深入破坏X门，洛克人前进踩左边蓝色机关，两边的门都开了，再分别由サーチマン和ナパームマン前进踩下一个自己那边的机关后，洛克人BOSS战。
然而战斗后仍然不能解除伙伴被吸走的命运，只好PLUG OUT了。
来到最后的障碍了，由炎山和ジャスミン负责帮忙，这次的比较简单，メディ打开混沌门，BLUES则打开木门，左边BLUES获得芯片リカバリー200 I，两为洛克人开路后，洛克人要前进一次见到下一障碍后，再由BLUES和メディ交换位置踩下一机关后，洛克人踩中间机关。右边メディ开门并拿到サッブメモリ，加大サッブ芯片容量，左边BLUES开门。
见到BOSS了，BOSS制造黑洞吸メディ，BLUES来救结果也被吸走，开战。
终于来到最后的门了，却见不到人，又发生地震，难道要火山爆发？热斗决定继续调查，左边水罐PLUG IN内有加秘密会数据并找到一个倒在地上的NAVI。知道事情后PLUG OUT调查中间的水罐，出现了隐藏门，全员此时来到为热斗加油。不过热斗还要继续调查左边水罐获得好朋友的PET。
做好万全准备后进去吧。（注意这里剧情比较长，BOSS战失败的话再战可以按SELECT跳过剧情）
PLUG IN后中途洛克人被围，可是细心一看，好朋友，好伙伴全来了，并帮助洛克人继续前进！
最终BOSS战了，BOSS有2000HP，对本体攻击是无效的，必须攻击围绕它的火球。BOSS和前作一样占了2*3格，地面攻击系芯片无效（电球除外）比较繁人的是地面经常有火出现，如果BOSS破坏地面则其攻击可以说是必中。
因此能力配置必须要有エアシユーズ或者プロートシユーズ，以便行走被破坏的格子，本战混沌共鸣失败也不怕了，暗黑洛克人只在BOSS召唤时出现，所以可以肆无忌惮的用…………。
最终BOSS战后剧情就不赘述了，各位自己看吧，但是…………那个邪恶大魔王的变化速度为什么会这么快？
NAVI CUSTOMIZER的秘密
在给洛克人装备能力NAVI CUSTOMIZER的时候我们可以通过输入特定指令将以下的部件减少一个格子，以便我们装备更多的部件，以メガフオルダ+１为例子，在图一的时候按住右不放，输入下面给出的指令即可看见少了一格，其实这个功能完全可以自己弄出来，因为输入正确或者错误都会有声音提示，这样就可以知道正确方法了
