六、BOSS战的话TIME UP也不怕，我方还有队员未行动的话可以接着打，这样会比较轻松，但注意一定要在本回合（P）内解决，否则BOSS会回复全HP，任务完成后再来本区和金色小NAVI对话可以再次挑战本任务。
能力搭配系统（NAVI CUSTOMIZER）：
和前两作一样的系统，岛上海滩剧情后获得，这次也没什么更新，所以和大家说说搭配的规则就可以了
1，同颜色的方块不能放在一起
2，无花纹的`至少一格在指令条上
3，有花纹的不许有格子在指令条上
4，颜色不能超过4种
违反的话洛克人就会出现BUG，例如战斗时候处于中毒状态，不接受操作等等异常状态。
灵魂共鸣系统：
战斗的芯片选择画面中选择与所拥有的灵魂相同属性的芯片之后，再选右下角的选项可达成灵魂共鸣，此时洛克人的状态和属性以及蓄力攻击均有变化，但是3回合（T）后灵魂失效。
暗黑芯片系统：
本作沿袭上作的暗黑芯片系统，芯片使用的限制降低了，但是最大HP减1的副效果依旧存在，虽然不用被K到洛克人表情变化即可使用，但是并不推荐使用。
混沌共鸣系统：本作又一新系统。
暗黑芯片也有属性，使用自己已经有的灵魂相同属性的暗黑芯片即可产生混沌共鸣，不过剧情要发展到收回洛克人后。
混沌共鸣最大的特点在于蓄力攻击效果为暗黑芯片的效果，但是最大HP不会象使用暗黑芯片那样减1，所以非常吸引人。
然而天下是没有免费的午餐，研究后具体如下：
1，蓄力满后身上的气会时大时小，这就是信件里提到的所谓暗黑力量大或小的情况了，把握好时间在气团最大的时候放就会发挥威力，小的时候放的话则会造成力量失去平衡，暗黑洛克人在敌人那边出现并且不断攻击。
2，第一次使用成功后以后再蓄力攻击气团切换的时间减短。更难把握时间
3，有效回合（T）数只有1，
因此使用混沌共鸣还需要分散自己的精神去看气团的变化，对战斗不利，所以也不是很推荐使用过多。
日暮店的密码机：（密码来源感谢CNGBA提供）
密码虽然可以在世界各地找到，不过由于各种关系，密码显得相当难找，而密码又可以提供多个不错的内容。下面就放出最新知道的密码
00798216アントラップ
90914896フルエネルギー
48958798ノイズストーム
28706568オープンロック
05068930ナビスカウト V
68799876暗黑芯片ダークインビジ *
45654128HP+100
91098051我们的太阳主角SP芯片
剧情篇：
第1章
老调子，热斗又在睡懒觉，洛克人将他叫醒，调查桌面获得PET，此时收到信件，查看过后下楼找妈妈，对话后得到シチューのレシビ（关键道具）回自己的房间PLUG IN电脑（按R）进入自己的主页后会有练习战斗，然后可以前往秋原エリア了。
在1区途中可以看见ロール，交谈后得知ガッツマン和グライド都在秋原2区。前往2区的路上蓝色数据分别为和800ZENNY。
秋原2区路上有个加了密的数据，以后再来吧。
另外一个未加秘的数据里面是芯片コピーダメージ *。
途中见到ガッツマン和グライド在交换芯片，（やいと是有钱人，珍贵芯片自然多........汗）2区商店有卖HPメモリ，有钱的话尽量先买了这个，增加HP上限20。
一路来到目的地后将シチューのレシビ交给NAVI后任务完成，收到爸爸的信息。PLUG OUT，和妈妈告别，去各个伙伴的家。
自家狗房可以PLUG IN，里面有REGULAR MEMORY（以下称RM）2MB，提高记忆芯片的能力。メイル家的电脑PLUG IN获得ミニエネルギー，デカオ的电脑PLUG IN获得HPメモリ，他的主页有个BBS，可以调查那里学习战斗技巧，やいと家的电脑PLUG IN得到800ZENNY，有个加了秘的数据和BBS。
这棵树后面可以PLUG IN，里面得到HPメモリ
和所有朋友对话后来到车站，去科学省，2楼有个科学家卖オープンロック不过要4000Z。
此处可以PLUG IN，内有HPメモリ
此处可以PLUG IN，内有BUG PIECE一个。芯片オーシャンシード *
上楼见到爸爸，结果发生事故，大家都中了毒气弹昏倒，爸爸被劫走，好朋友的PET也被抢去，好在热斗在另外一个地方而没事。
醒来后发现自己已经睡了3天（汗........)
PLUG IN自己的电脑发现网络世界一片黑暗，来到2区与邪恶NAVI战斗后收到信件，PLUG OUT，下楼与妈妈对话。然后去科学省，在车站门口和メイル对话获得ロール R和メイルのPコード，可以打开从メイル的主页到秋原区间的方块。
到科学馆后，一个大叔从里面跑出来，到那个大叔出来的地方调查发现不能进，上2楼爸爸的工作室调查电脑获得パパのIDカード，顺便PLUG IN，其中一个水晶加了秘，另外一个为RM 2MB。
回到刚才大叔跑出来的门那里，这下可以进了，对主电脑PLUG IN。
注意以下内容直接按照给出的顺序调查即可通过而不是照这个顺序将密码排列
第1个迷题，按顺序调查7，2，6，空格即可通过，途中的蓝色数据为芯片サンダーボール P
第2个迷题：按顺序调查コ，ン，イ，空格 ，通过后获得HPメモリ
第3次：按顺序调查タ，ウ，キ，ヌ，ギ，空格，然后去左边踩按钮，通过
第4次，按顺序调查ノ，ム，キ，ニ，ミ，空格
第5次：按顺序调查タ，コ，ギ，マ，ミ，ビ，空格，然后左右两边踩按钮，通过，箭头那先不要走，再向前点获得フルエネルギー
到了12345那里后发生剧情，此时候为热斗行动，到爸爸的工作室沙发那里调查得知顺序为53214
