又到了魔药学(Potions)的上课时间，众人返回大厅，通过左侧的地下室(Dungeons)，进入魔药学教室。今天的课程是学习制作缩小液，需要收集一些配料，于是Hermione和她另外一位朋友又很荣幸的被选中做志愿者……需要收集的素材一共有5个，分别是daisy root、Shrivelfig、rat spleen、dead caterpillar和leech juice。选哪一个组队分别不是很大，只是如果选哈利(Harry)的，路上会遇到火堆挡路，需要用Glacius魔法将其浇灭。击败挡路的河流食人妖(River Troll)并齐集5样素材后，原路返回将素材交给教授，成功的作出了缩小液，并获得了新魔法Wingardium Leviosa。
下面的课程是黑魔法防御术，虽然该课程的专用教室在3楼，不过从Hermione的口中得知教授让大家去职员室集合。于是众人来到大厅右侧的职员室(Staff Room)，里面的教师当然就是大家熟悉的Lupin教授了，授课内容是如何对付幻形怪(Boggart，一种可以任意变成心中害怕目标的奇兽)。这是第二个小游戏，游戏内容为阻止幻形兽靠近试验者，当幻形兽向某一试验者靠近时，按与该试验者相反的方向键。比如幻形兽向上方的试验者靠近时，就按方向键的“下”，让幻形兽接近试验者或所按方向错误，都算失败，最多有3次机会。游戏结束后，哈利向教授质问为什么不让他参加试验，经过教授一番解释，并且答应下次教哈利如何抵御狱卒后，哈利终于高兴的和同伴们离开职员室。
按照Lupin教授的建议，众人返回了7楼的休息室，正赶上两只宠物又在上演猫鼠大战。结果哈利不得不又一次帮助Ron找回逃走的宠物鼠Scabbers。出了休息室后，一直向右下方走，就会看到Scabbers，找到它后二人返回去时，发现很多同学都聚集在休息室门口。经过询问才知道，原来画面上的肥女人(Fat Lady)不见了，通往休息室的门也因此被关闭，取而代之的是一名老骑士Sir Cadogan。众人想向他询问那个肥女人的去向，虽然他说他知道，但却一溜烟的跑掉了。于是众人经过商议，由哈利留在原地等候肥女人回来，而Hermione和Ron则负责寻找Cadogan爵士。通过询问其他的壁画们，在2楼发现了Cadogan爵士，在他的指引下终于找到了肥女人。原来她是被天狼星Black打跑的，看来这里也不安全了，2人急忙赶回休息室向哈利示警。虽然众人很担心Black是否仍在学院内，但课还是要去上的。这一次依旧是黑魔法防御术的教程，哈利很担心Lupin教授的身体，Ron更猜测这种教学对教师本身会造成伤害。来到3楼的黑魔法防御术教室，结果发现上课的竟然是Snape，他解释说Lupin教授由于身体不适而改由他代课，并且要教授大家关于人狼的课程，尽管这些内容Hermione早就学过了。
众人来到2楼右侧的图书馆(Library)，向Pince女士询问有关人狼的书籍，结果被告知唯一一本关于人狼的书籍也因为怪兽之书的破坏而变成碎片。Hermione于是提议将碎片收集起来，再用她的修复魔法Reparo将书复原。图书馆有上下两层之分，而且那些带符号的书籍是可以用Flipendo魔法移动的。击败怪兽之书，并齐集全部5张碎片后，返回Pince女士那里，成功的将书复原。Hermione让哈利和Ron先回课堂搪塞一下Snape，她自己一会儿就把调查报告写好。二人回到3楼的教室，正不知如何对Snape解释，没想到Hermione已经赶来并提交了一份优秀的调查报告。哈利和Ron对她能够如此迅速的写好文章感到惊讶，尽管Hermione解释说她以前就看过这本书了，但2人还是感到难以置信，并跟着Hermione返回休息室。
在休息室中，哈利的信使猫头鹰Hedwig送来的包裹挂在了信息板顶上无法取回，Hermione建议使用Wingardium Leviosa魔法使包裹飞下来。打开包裹后发现是一只火闪电型号的飞天扫帚(Firebolt Racing Broom)，由于不知道是谁送来的，Ron不免猜测起来，Hermione也觉得很神奇，并建议去找McGonagall教授查一查，但哈利此时只想尽快让Hagrid看看自己的火闪电。来到Hagrid在城外的住处，却得知鹰马Buckbeak因为袭击Malfoy而被关进了监狱，Hermione这时说她曾看过一个关于鹰马的案例，于是Ron建议去图书馆查找相关资料。在2楼的图书馆向Pince女士询问，得知在图书馆的南面有相关资料，2人来到右下角，终于发现了那个案例。但结果却非常不好，按照法律规定，鹰马要被交给危险生物处分委员会(Committee for the Disposal of Dangerous Creatures)处理。哈利觉得暂时还是不要把这个结果告诉Hagrid为好，应该先跟Hermione商量一下。在2楼的入口处碰到了Hermione，但除了感叹外，众人也拿不出什么好主意。话题一转，大家又讨论起今年的圣诞宴会，Ron已经等不及了，但Hermione却推说还有重要的事要半，让他们俩先去，真是奇怪！
来到1楼大厅右面的Great Hall，还没等坐下，就被McGonagall教授叫住，并且借口要检查飞天扫帚是否有附加魔法为由将火闪电没收了- -，而这一切竟然都是Hermione告的密。Ron马上质问Hermione为何要这么做，Hermione却解释说，她这么做是因为怀疑火闪电是天狼星Black送给哈利的。正在这时，一个白胡子老头(Dumbledore教授)蹦了出来，并且说发明了一种新游戏供大家娱乐。这是第三个小游戏，内容比较老套，点击画面相邻的2个以上的相同物品就会将其消掉，等级越高，不同种类的物品也越多。
结束游戏后，哈利正要返回休息室，Lupin教授竟然主动提出要教习哈利如何抵御狱卒，哈利当然乐得答应。来到3楼左侧Lupin教授的办公室(Lupin's Office)，Lupin教授准备教给哈利一种特别的魔法来抵御狱卒，并进入第四个小游戏。这个游戏跟第二个比较类似，所不同的是，这一次是由四个狱卒围住哈利，当有狱卒向哈利移动时，要按动该方向的按键来施展魔法进行抵御，如果累计按错次数达3次，就会被扣一次试错机会，一共有3次机会。游戏结束后，哈利借机向Lupin教授打听他父亲和天狼星的事情，但Lupin教授没有正面回答哈利，只是推说太晚了，让他回休息室去。
回到休息室，McGonagall教授将火闪电还给了哈利，并预祝他胜利……画面一转，哈利他们已经获得了胜利，大家正在庆祝，McGonagall教授又不合时宜的进来将大家都赶回宿舍。哈利进入上方的葛来芬多男生宿舍(Gryffindor Boy's Dormitory)，正准备休息，却突然听见Ron的尖叫。哈利赶忙跑过去查看究竟，原来是Ron被砍击窗帘的声音惊醒，却发现天狼星Black正拿着一把刀子。哈利建议去找McGonagall教授，出了宿舍，发现大家都到了。经过调查，才知道Black是用一张写有密码的纸才骗过守卫Cadogan爵士的，而那个把密码写到纸上的家伙就是……Cadogan爵士因为此次事件被解雇，肥女人又重新回来。哈利回到宿舍就却难以入睡，并且偶然发现Hermione的宠物猫Crookshanks正和一只黑狗在散步……第二日一早，哈利正要出门，发现Hagrid留下的字条，上面写着“亲爱的哈利，我们输掉了官司，Buckbeak执行死刑的日子已经确定下来了，Hagrid”。哈利看到后大吃一惊，决定找Ron和Hermione商量如何搭救Buckbeak。众人来到Hagrid城外的住处，但依然一筹莫展，甚至连安慰的话也无从讲起。这时Ron的宠物鼠Scabbers突然出现，与此同时，刽子手Macnair也来了，哈利3人因此被请出了屋子，不多久就听到Buckbeak被处决的声音。众人尚未来得及悲伤，Ron的宠物鼠Scabbers突然躁动起来，咬了Ron一口后跳出口袋，但马上就被Crookshanks叼走。在众人把注意力都集中在猫鼠那里时，那只哈利看到的、曾与Crookshanks一起散步的黑狗突然出现，并且把Ron叼进了Whomping Willow。哈利与Hermione战胜守卫的大树后，也跟着进入Shrieking Shack Path。
