序章
开场后是剧情，介绍哥斯达黎加遭遇不明军队袭击，Big Boss被米勒等人请来，并被劝说组建一支军队来对抗敌人。不过Big Boss似乎并不是很愿意。但是还是接受米勒提出的侦查任务。
任务1-1：
玩家开场一路向前进发即可，到达搁浅的小船处时可以看到地上的手雷（如下图），请务必回收，否则无法继续游戏。拿到手雷之后，继续往右侧走，会看到锁着的铁门。使用手雷将铁门炸开后继续前进。
任务1-2
玩家开始遇到敌人，但是大家完全可以无视他们溜过去。进入版面后位置如上图，开场注意眼前背对你的敌人，轻推摇杆向左侧移动。之后一路中路，注意贴着土丘前进。到达地图右侧如下图位置时会看到道具“干粮”，这是游戏中的HP回复道具之一。玩家可以装备干粮以获得自动复活的功能。获得干粮之后，缓慢贴着地图边缘行动，你会看到一个背对你的敌人，解决与否全看你。如果你想无视他，就轻推摇杆偷偷溜过去即可。
任务1-2 干粮位置图
任务1-3：
第一个任务的最后一个版面，开场后往左侧走，到达地图最上面可以找到“爱心箱”一个。之后从获得箱子的地方切到中路，然后缓缓前进，上楼，然后到达终点。在中路时注意右侧的警卫，他在移动时可能会看到你，上楼梯时注意左侧的警卫，如果他背对你巡逻时就可以趁机溜上去。楼梯上面也有一个警卫，不过他的巡逻路径非常长，绕开他可谓十分容易。
如果你得到了箱子，你也可以套着箱子一路跑到终点了，不过注意不要在敌人看到你的时候移动，也不要挡住他们的巡逻路线，否则他们会调查你。
之后又是CG时间，Big Boss发现一个通讯站。在站内，Big Boss成功制服了通讯站内的通信人员。注意，这里会用到过场QTE，注意过场上的提示，出现在右上角和右下角，按
开始，错过了会反复播放此段开始战斗的动画，所以不用担心错过。然后连续按
来与对方对抗，然后再次按将对方制服。
CG结束后，序章结束。玩家来到基地界面，并且增加诸多任务。COOP模式也开启了，玩家们可以拉着朋友们一起来玩了。
此时任务列表新增内容：
主线任务：サソディニスタ司令官接触（1~2人玩）
Extra任务10：フル卜ソ回収（1人玩，MSF士兵限定）
游戏至此进入Act.1
