一开始，我们就要选男女主角（我玩女）。之后如金银的操作直到设定好日期。发现家里多了一个女人。暂且不理她，去空木博士那里拿精灵。他会问你一个问题，如果你答“否“他会不停地重复这个问题，直到你答“是”为止（水晶版的空木博士发癫？）。
从152/155/158选一只后就出发了。 在29号路发现了161（在43号路也有）和187（在30-33号路也有），看来金银版罕见的精灵在这里变得常见了，当然，波波和小哥达还是原来那么多。 接着就是拿地图和图鉴。回去博士那里时要跟宿敌交战，发现还是原来那个宿敌（看来任天堂公布的那个是另外的人物）。回去把奇异蛋交给博士，就有精灵球了。通过29-30-31号路（别忘了捉喇叭芽来换大岩蛇），打败喇叭芽灯塔的众多神棍，取得秘传机器05（Flash）之后去取得第一个徽章。大佬还是飞行系的。 先去遗迹完成万年虫拼图（大家肯定发现遗迹有很多人。看来这里已经被开发得七七八八了），捉到3种201，拿到201图鉴；再在32号路的第一个人那里拿到加草系攻击力的道具；然后向下走。在Pokemon Center拿到破烂鱼竿，通过连接洞穴到达槐树镇（ヒワダタウン）。 与金银版相同，先去叫岩铁爷爷，之后去小呆兽之井打火箭兵团，打败他们后拿到钓鱼球。水晶版好像可以一天收到N个同种的球的订单（我没试过，但是看画面好像可以这么做）。再来就是打败虫系的大佬。 记得在连接洞穴看到有穿山鼠，联想到阿柏蛇会去哪里？一查图鉴：32号路就有！捉了绿毛虫，查看独角虫—跟绿毛虫的出现地点一样！看到敌人的165和167，也看图鉴：都有！看来水晶版把金银分开的精灵聚在了一起，方便了一些不通信的玩家。
在森林解决火葱鸭事件后取得秘传机器01（Cut）。记得拿到TM02，否则商店里不卖的。在出口拿到TM12。在34号路发现209（出现率颇高）。 黄金市也有了很大的变化。如Pokemon Center变成了多功能精灵中心（PCC）（就是可以用手机上网交换精灵的地方，GB带说明书有写），电台改组，Game Corner的奖品变了等。要说的是新的电台节目主持人，她在2楼搞了一个积分换领处，你只要多多收听电台她的节目就能换领像升级糖HP，UP之类的好东西。另外，打败大佬后要去185的旁边把花店主人的妹妹找回来，否则主人不给你车里龟喷壶 重复黄金市的HITS：1。SHOP右下角：单车店，看亲密度地点2。PCC左下角：地下街入口，正辉的家3。地下街：COIN CASE，珠宝/美容/草药店（开张时间略），火箭兵团基地（以后才去这里） 4。电台塔：收音机卡（答案：Yes/Yes/No/Yes/No），蓝色积分卡（2F） 5。火车站：不能使用6。地下街上方入口，改名屋，GYM（BOSSアカネ），花店7。SHOP的B1F和5F的事件（跟金银一样）自然公园： 1。尼多和191只在这里出现。2。TM28（钻地——强力推荐）和先制之爪（一个女人手上） 3。捉虫大会（一样的） 把185解决以后别忘了在36号路问人拿TM08（之后有得卖）。
终于到了エンジュシティ。在GYM右边拿到探宝机，在PC上方打败众进化型伊贝的训练员拿到秘传机器03（游水），到GYM打败BOSSマツバ（机关破法略）。最大的变化是火烧塔，进去看看。 进门后发现任天堂所说的ミナキ在门口，宿敌在中间。好在和宿敌打架不要用爆石（TM08）。谁知打完架后宿敌竟然开启机关使主角掉到下面一层楼去了！此时千万不要用钻地（我没试过，但是觉得这样会有点不妥）。赶跑三圣兽之后ミナキ出现，他说他一直在研究水狼，这次它复活逃走都是你的错，你为什么破坏他的好事。之后他离开了。主角可以找到楼梯离开此地。 在38号路的农场同样要解决奶牛坦克事件（7个木之实）。来到浅黄市，竟然发现有一座战斗塔（バトルタウ—）（上网才有用）。在Pokemon Center旁边有秘传机器04（推石），在某间屋有普通钓竿，右边的一间屋有人要用霹雳弹换大钳蟹。 去浅黄灯塔，在最顶层找到GYM的BOSSミカン，她叫你去タンバシティ的药店找秘传药 通过40和41号水道来到タンバシティ。发现有只水狼站在你面前！可以捉吗？走近后它跑了！ミナキ这时出现，说主角破坏了他的计划，要跟主角战斗。打赢他后他走了。 水狼旁边的小屋的主人会告诉你你的精灵的捕捉地点、捕捉等级和个体值的大概情况。 在PC的上方拿到No。213乌龟，PC左边拿到秘传药，打败BOSSシジマ之后找门口的女人要秘传机器02（飞天）。 回到灯塔，把秘传药给ミカン，然后去GYM找她挑战。下一个目标是愤怒之湖，把闪光鲤鱼龙捉住以后，五天王之一阿渡（ワタル）出现，他会先走。 进去43号路左边的小路，在星期三有黑腰带（格斗系攻击力1。4倍），小屋里有TM10。去チョッジタウン的火箭兵团小屋。 B1F的机关要抄小路才能打开（否则很麻烦，但是有更多钱和经验值）。在B3F找最左边那个男的的和小房间上方那个女的拿密码。 打败里面的BOSS后找那只鸟拿密码，之后回B2F解决3只雷霆弹。结束后，从阿渡手中得到秘传机器06。接着去打BOSSヤナギ。 然后要解决电台塔事件。在3F的中间楼梯上去打败有6只毒气丸的BOSS，拿到地下钥匙。 去地下街的右上方开门，进去拿钥匙卡和赚钱符（进门后宿敌找你单挑，机关破法暂略） 之后回去电台塔开门。把BOSS的地狱犬打败之后，电台台长给你冬眠之铃（どうめいのスズ）。在下面可以找クルミ拿粉红丝巾（加普通系攻击力1。4倍）。 在3F找一个女的拿TM11。
接着我们要去铃之塔。跟1F的老伯谈话后他给你进去，接着要跟3个神棍交战。 进入铃之塔，发现雷虎和炎狮逃走了，留下水狼。这次水狼不会逃走，你可以直接收服它。之后ミナキ和3神棍出现（不管有没收服），其中一个神棍告诉你要集齐三神兽才能捉凤凰。 搞定水狼之后，回到チョッジタウン。经过冰之道（有124和215）后来到フスベシティ。（1F过法：↑←↑←↓←↑←↓→↓→） （3F有不溶之冰，加冰系攻击力1。4倍）市内有忘记爷爷的屋（可以忘记招式），有人用哈古龙（女）换铁甲暴龙。 去干掉BOSSイブキ之后，仍然要走一次龙洞。不过这次没那么简单！把龙之牙拿到后イブキ还不出现！其实，去那里的小屋，回答对里面爷爷的问题，イブキ就会出现，给你徽章。 如果你身上的精灵少于6只，还能向爷爷要迷你龙。之后回到家，找空木博士拿MasterBall。终于要打五天王了！首先要有游水和冲瀑布。在瀑布洞穴可以拿到月之石。 在出洞时有间小屋，你的精灵亲密度够高时能向主人要TM37。接着游水过去，消漩涡之后可以拿到TM22——阳光烈焰。 在27号路的一间小屋可补HP，另一间小屋是每天给你一个加攻击道具的人的家。通过8徽章验证之后进入冠军路。里面有TM26——地震。出洞前打宿敌。
