回顾一周目我们打道馆，四天王和冠军，而二周目则以剧情为主，按照流程走，可以抓裂空坐，在这些都完成之后我们还有很多内容需要去完成。
二周目剧情结束，回到家，一觉醒来下楼，父亲上前给主角战斗区域的船票S.S. Ticket，乘船过去，给战斗记录器。
出门之后，博士又来了……
主角上前救他，从他包里选小精灵，这次是金银版和心金银魂版的御三家。
之前去野生原野区Safari Zone，必须同时拥有飞跃自行车和马赫自行车才能去到每一个地方。通关前只能在有需要时前往紫堇市的单车店更换，通关后就可以同时拥有飞跃自行车和马赫自行车啦，方法是：
先在111号道路的沙漠区骑马赫自行车冲上平台和以为灵异狂对话。
在119号道路天气研究所右边瀑布上去，用飞跃自行车跳上一块平台，和上面的一位饲鸟使者对话。
在对战名胜区海边的一角和一个骑自行车的人对话。
最后回到紫堇市的单车店，老板说因为主角骑着他的自行车到处跑，导致最近生意特别好，所以让主角同时拥有飞跃自行车和马赫自行车。
然后我也没干别的，去收集所有能抓的神兽，目前收集到这些，（详见：口袋妖怪红蓝宝石复刻版神兽捕捉图文攻略步骤）
为了抓之前被我打死的代欧奇希斯，我又去打了一遍四天王和冠军，二周目之后四天王和冠军的PM阵容及等级都提高了很多。
赢了之后大吾会给你巨金怪石
回到家妈妈又送你拉帝亚斯石（拉迪亚斯在哪呢……逼我又去买了个蓝宝石……）
