众人再次回到天使之塔，来到塔边的地下封印，就可以找到封印迪斯的地方了。封印慢慢地解开了，迪斯叫龙到面前来安慰了几句后便说她在火山处等众人。说完便飞走了。龙一行人依约来到火山那个原来没有任何反应的神殿中，在此由龙带队调查那道石门便可进入，在神殿内部要吧见到变成蛇人的大魔导师迪斯。在此回答迪斯的提问时选“今の姿の方がいい”，接着让加朗德”进来了。在此地迪斯告诉二人要想解开龙族被灭之迷一定要去北方一处神秘的所在才行，而那个地方很可能便是神的领域。迪斯还相信只要找到神就可以将所有的迷解开，但以后的事就只有靠龙自己了。于是龙与加朗德到外面决定找般到外海去。
众人离开火山后来到拉巴拉在宿屋中找到星卡希望他能帮助出海，可是他说想要乘船一定要去吉桑库村找到贝伊特才行，没办法只好先去吉桑库村，在村中找到贝伊特便可通过原来被守卫挡住的村口。出村后随贝伊特来到海边的多库，到了海边可在码头找到贝伊特，可是他说因为要修理船很麻烦，再加上所需的零件不足暂时没有办法让船起航。于是由毛毛领队上前协助他，贝伊特带领毛毛进入船内调查，经毛毛检查了机械也得到同样的结论--零件不足，而所需的零件必须去“机械浜”才能找到，于是毛毛画了一张所需零件的图纸就经带好，并要求龙按图纸把所有的零件全部收集到。龙一行人辞别了毛毛准备去“机械浜”，但必须先得到“机械浜”首领的同意，而此人就在姜库村，于是一行人返回姜库村找到“机械浜”的首领，希望取得他的同意。众人得到此人的同意后接着便可来到“机械浜”，在“机械浜”中得知所需的零件要到破船里才能找到，而看守破船的人因船内有怪物出没不让众人入内，还说要想进入必须得到另外一位人物的许可才行(真是麻烦)。在这里的海边的猴子口中得知在它旁的人就那位重要的人物，这时只要让加朗德带队与他对话就可发生情节。他会提出同他一起把海上的物件拉上岸的请求，加朗德答应后，他会教你控制的方法，方法是不断地按○键，但是必须注意距离不能相差二米以上，否则会失败，而当猴子举起红旗时按○键，举起白旗中停止按○，直到将海内的物件拉上岸为止。但是当把东西拉上来时发现并不是要找的东西，而是一条怪鱼，而战斗也随即开始，战胜后那个人觉得麻烦大家实在过意不去，于是便答应众人可以进入破船中。
于是龙一行人进入左下方的破船里找零件，大家进入破船后要仔细寻找，由于几乎在每个角落都有可能找到，所以要不断地切换视点。其零件(パ-ツ)分别是A到H的形状，而零件的总数则为A×2、C×3、D×2、E×1、F×2、G×2、H×2。当然在这些零件之中有些是要在海滩上才能找到。只要把零件全部找齐即可返回码头找毛毛。毛毛得到了所需的零件后很快便把船修好了。而贝伊特也为了表达感谢之情而把船交给龙使用，在航行中有人提到了传说中在外海才能遇到的“黑船”，而更奇怪的是该船没有任何驾驶员，就在这时妮娜发现一艘大船向之驶来，从画面上可以看出那可能就是传说中的“黑船”。不久船回到拉巴拉，贝伊特为了感谢龙便让手下充当龙的舵手，但是大副却硬要强行做舵手，众人没办法只好随他，于是再次乘船出航。
在航行中龙说想到外海去，但由于船太小的缘固而不能开进外海，这时大副会说要想到外海除非找到“传说の船乘”。而寻找这个人十分不容易，首先要到巴齐村找村长，找到村长后发现他由于饮食不调而不回答任何问题，而旁边的人说要想解决此事必须为村长找到四种东西才行，它们分别是：シオタ鱼、ス-の水、スビ草、シセ-リイの实，而有关这四种东西必须返回美卡斯峡，在此地的一间小屋中有人会告诉你这四样东西的所在地，由于有了地点所以找起来并不困难，但要注意在取ス-の水的时候必须由加朗德带队才行，而在打水时必须掌握好时机不然很容易失败，还有一点是在寻找时每种物品尽可能地多拿。待拿到全部材料后返回那间小屋得到料理的方法就可再次回到巴齐。找到村长后为其料理，方法是先用シオタ鱼与シヤ-リィの实进行にぎる(混合)，再加入サビ草×4和ス-の水×2，最后再加入シセ-リィの实×8(明白为什么要多拿了吧)。待做好料理后让村长吃下，由于美味可口使得村长十分高兴，于是他便告诉众人“传说の船乘”的所在地，同时还交给众人一本“海流の书”。并且说因为海流太急大家要利用“海流の书”才能找到那位“传说の船乘”。
当众人乘船驶入内海中那个“?”地带时由于有了“海流の书”于是便出现一张地图，在地图中那红色的地方便是“传说の船乘”的所在地，这里大家要行动迅速，因为在时间限制，所以不能太慢，到达目的地后龙便寻问有关外海的事，但是那个人并没有回答，突然“黑船”出现，那个人说如能得到“黑船”或许可以到外海。于是，众人便决定夺取黑船，在内海中要用□键加速去撞击“黑船”的尾部即可登上“黑船”。登上“黑船”之前必须让毛毛在队伍中，因为黑船内的机械只有毛毛才能打开。船的内部有如一个巨大的迷宫，详细的流程就不向大家介绍了留待玩者自己去攻略，这里只提醒大家一定要得到I.D卡，得到此卡后的问题都可迎刃而解。到达控制室时让毛毛调查主控台，这时毛毛会让你到下层一间机房内找开机关，还要求得在数到100时通知她，这里要注意一定要在机房的数字达到80以内时离开，在返回主控室的路上要在心中默记数字的变化(有声音提示)，等到达主控室而数字达到99时立即与毛毛对话即可令“黑船”启动。在航行中开始还算平安无事，但不多会儿毛毛说船出现了问题并且让龙去甲板调查一下，龙带了两个人来到甲板后遇上了两只怪物，于是便与之战斗，怪物的弱点是雷系魔法，很快就可将它们击败。之后过了几日便可到达目的地。
众人来到了一个叫做“空碧那特”的地方，在这里众人不断打听有关神的情报，但失望的是没有任何答复，于是众人起程向东北方的“机械墓场”前进，通过“墓场”(这里的敌人比较厉害，要小心)来到“卫星”，进去后发现了一个巨大的卫星天线。而且众人还在此地找到了与王城一样的传送装置，这里的门很多大家必须找到一处可以从玻璃天窗跳下的地方，在这里利用光线反射的原理来启动机关，成功后进入传送装置，众人被转到另外一个地方。出来后会发现这里是原来“机械浜”的破船内(原来不能打开的门的后面)，妮娜对毛毛说传送装置是否有问题，毛毛经过思考得出结论可能是卫星天线有偏差，于是在此地找到天线的控制台，经过调查发现天线的位置不对，于是便着手修理天线。说是修理其实就是把天线转到没有任何杂音的位置即可成功。修好天线后玩者就可以通过传送点到世界各地了。首先，要通过传送点来到ドラグニ-ル(龙族之村)，在村中众人受到了热情的接待，而村中的人说他们已经等待龙的到来很久了。村长让龙去找这里的最长老，还说最长老是唯一知道上一次大战的人。众人在地下室找到最长老，他向大家解释了壁画的意思，原来400年前龙族的勇者们聚集起来与邪恶势力对抗，而邪恶势力就是以恶魔形态出现的女神米丽亚，而米丽亚也是众人要找的神。跟前长老让加朗德到他面前，当加朗德问是否恨他时，长老回答是这都命中注定的，人力无法换回，之后长老让妮娜到他身边，告诉妮娜因为米丽亚女神因害怕龙族的力量而灭绝了龙族，而在上次大战中如龙族的人使用了龙的力量世界也就灭亡了，因此龙族在上次大战中被打败。说到这里长老让妮娜吻他，而妮娜问龙的意见，这时选择“ベっに、かまわないでは?”。之后再让龙上前说他要把龙族真正的力量传给龙，说着把龙的变身能力封印了，这时长老变身成一条巨龙与众人战斗，由于这时龙不能变化所以战斗十分艰苦，最终龙凭借本身的力量战胜了最长老，胜利后最长老化成最后一块变身水晶，而龙也因此得到了龙族最强的力量。回到村中，村长把女神的所在地告诉了众人，但首先必须通过“死の沙漠”。在村口找到向导浩伊斯后便可出发。在去沙漠之前首先要经过废工厂，这里的地板充满了电流，必须将控制杆拉下，不然地上的电流会夺去你大量体力，此时毛毛必须在队中，有她很容易便可通过这里。
