身为少年之影，在游戏中只能够在真实世界中物体所产生的影子上移动，却无法触碰任何真实世界的物体，冒险只能在光与影的界线上进行。
游戏的基本进行方式是操作主角在物体、墙壁或地面上的投影上进行移动，但影子与其产生的物体之间也会产生影响，利用这些影子的变化才能顺利前进。例如，在影子的世界中搬动机械的操作桿，那么真实世界中的操作桿同样将会被开启，机械便开始运作。
游戏中主角还有一位同伴，它就是神秘的黑蝶（クロアゲハ）妖精。与主角不同，妖精可以在现实世界中直接接触物体，在主角无法找到影子前进的场所，可透过妖精对现实物体的移动而产生新的影子。例如有相聚很远的两个箱子的影子，普通状态下主角无法从一个箱子的影子上跳跃到另一箱子的影子上，此时妖精可以移动挂在屋顶的灯泡，随着灯泡的移动，箱子的影子也同时移动，此时产生的最近距离便可以使主角通过。
《影之塔》的核心游戏理念是“在光与影界限中的冒险”的设定，早在日版发售之初便吸引了许大部分玩家的眼球。游戏讲述了一段奇异的故事，主角是一名被困在高塔顶的少年，身体和影子的连接却被某神秘武士用剑斩断，并将影子丢到了高塔下，于是少年的影子在精灵帮助下，踏上了为取回身体而向高塔顶端进发的冒险之路。
