女神异闻录P3在学园生活的流程方面需要玩家对角色进行能力培养，这套个人能力分为：“学力”、“魅力”、“勇气”三项。这三项个人能力的高低直接关系到COMMU角色的触发条件。为了能获得强力的COMMU能力玩家必须在紧凑的校园流程里尽力提升这三项能力才行，个人能力一共各分六个等级，达到最高后将无法再提升。第一周目很难把这三项能力都提到最高，这三项能力在通关后是可以继承的。
提升这三项能力就全靠平时点滴积累，比如要增加学力的话就要靠上课时认真听老师讲课、去图书馆读书、夜间努力读书、神社祈祷等。而要提升魅力的话就要在上课时回答对老师的提问、去商店街消费、和朋友去看电影等。要提升勇气的话就要靠在路边商店吃东西、去唱卡拉OK、去喝保健老师的秘方...等等，以下各别说明。
学力
| 能力 | 项目与提升数值 | 提升方式注解 |
| 学力 | 课间学习 +2 | 在上课时选择“目じない”听课不睡觉。 |
| 学力 | 暑假补习 +3 | 强制发生事件。 |
| 学力 | 图书馆看书+2 | 去学校1楼图书馆学习，消耗一时刻。 |
| 学力 | 自室深夜学习+2 | 夜间不进入影时间直接回自室的话，可以选择在书桌前学习到深夜。 |
| 学力 | 汉堡店 +3 | 去严户台站的汉堡店消费680元，消耗一时刻。不要问我为什么吃汉堡能提升学力，这个世界上有很多事都是无法解释的... |
| 学力 | 暑假映画祭+4 | 需要朋友邀请才能去，要求关系很好才行。 |
| 学力 | 神社赛钱箱子+1~3 | 去长鸣神社的赛钱箱捐钱，根据捐钱的数目决定成功率。捐1000元有75%的成功率，捐100元50%，捐5元10%。消费一时刻 |
学力这项是最容易提升的，因为学校流程中很多地方都可以不花时间的提高。平时夜间出去逛商店后回自室还可以继续读书提高。原本PS2版里必去的长鸣神社是不花时间的，现在改成花费时间了，这样一来捐钱提升这点已经基本没意义了，因为不但花钱不低，效果还随机。所以只推荐图书馆和汉堡店，自己做选择吧。学力够高的话考试的名次就能提升，考第一名的话能提升魅力+4。
魅力
| 能力 | 项目与提升数值 | 提升方式注解 |
| 魅力 | 回答问题 +2 | 正确回答老师提问或告诉被提问的人答案。基本上答案都是老师之前说的，不懂日语的话靠猜有点难度。 |
| 魅力 | 锅岛う—メソ +3 | 去严户台商店街的锅岛う—メソ 消费900元，消耗一时刻。 |
| 魅力 | 契茶シヤガ—ル、まんガの星 +2 | 去严户台商店街的茶室或ポロニアンモール的咖啡店消费500元，消耗一时刻。 |
| 魅力 | 映画馆 +4 | 奇数月去严户台站映画馆看电影，消费1500元，消耗一时刻。 |
| 魅力 | 暑假映画祭 +4 | 需要朋友邀请才能去，要求关系很好才行。 |
| 魅力 | 考试 +1~4 | 每逢考试成绩公布时根据名次高低获得1~4的魅力，第一名获得+4。 |
魅力这项的提升稍微注意下就可以了，上课提问这个环节只要能回答对就能提升。作为唯一夜间能去的ポロニアンモール区内的夜营业商店要提升有钱就没问题，不进入影时间的话来ポロニアンモール区首先要考虑的是光顾卡拉OK提升勇气，在卡拉OK店没开门的情况下就去咖啡店提升魅力。
勇气
| 能力 | 项目与提升数值 | 提升方式注解 |
| 勇气 | 学校保健室 +2 | 疲劳或风邪状态下去学校1楼的保健室喝下保健老师制作的“奇怪秘药”又见老白干，原来中国特产酒除了能治X南变小孩的毛病外还有这么多用处... |
| 勇气 | カヲオケ +2 | 去ポロニアンモール的カヲオケ卡拉OK店消费800元提升，消耗一时刻。 |
| 勇气 | ハソバ—ガ—シヨツプ +3 | 去严户台商店街的ハソバ—ガ—シヨツプ快餐店消费500元提升，消耗一时刻。 |
| 勇气 | 映画馆 +4相关推荐
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