HARAB SERAP（飞手腕的大猩猩）：
HP1500
爆发无效
初期主要装备：前面回避*3
第一次BOSS战，但老实说打起来比较麻烦，敌人HP并不算太高，但只有SNAKE一个人，而且敌人初期就有3次前面回避，战斗中还会再补充，正面几乎没有命中的机会，体型又大，很难绕到背后，爆发无效又让所有的手雷飞弹失去作用。
建议携带ID2 FAMAS/G1及弹药、ID62 ACTION++（必带，就SNAKE一个人，再不加行动次数打起来就太难了）、ID381 太陽バンク+、6格以上的远距离移动卡、ID245 ACTION+リンケージ和ID516 ACTION+リンケージ+、ID424 ジョニー佐々木+、ID423 オルガゴルルコビッチ+和ID514 ドロー3リンケージ+（这三张是针对多次行动后会卡片不足准备的，注意ドロー3リンケージ+需要ACTION+リンケージ发动时才会LINK发动）、HP 回复品以及COST回复品（一定要多带）。
敌人行动力并不太高，并且手腕发射出去后需要一段时间重新长出来，战斗中主要保持低COST以间接增加行动次数，绕到背后攻击或绕到侧面利用战场角落的折射板攻击敌人背面，以FAMAS/G1的COST附加攻击同时延缓敌人的行动时间。
VINCE（面具巨人警备部长）：
HP1500
初期主要装备：前闪*2
和VINCE警备部长的初交手，敌人只有这一个，主角变成了两人但BOSS实力却比上一个弱。
建议携带ID2 FAMAS/G1和ID519 AN94アバカン+的武器组合及弹药、6格以上的远距离移动卡以及HP回复品。
敌人只是行动力高点而已，扔铁桶攻击虽然距离极远但很少用，BOSS自己就会主动往主角这边跑，又时常会用没任何效果的威吓攻击，FAMAS/G1加AN94アバカン+绕背面攻击就能轻松搞定，其实是怎么打都能过。
GOLAB（扛油罐的喷火男）：
HP1600
引火无效
初期主要装备：前闪*2
看了数据就会知道这人基本和VINCE一样废，引火无效的意义也并不大，毕竟只有他喷火烧主角，没必要让主角去烧他。
同样建议携带ID2 FAMAS/G1和ID519 AN94アバカン+的武器组合及弹药、6格以上的远距离移动卡以及HP回复品。
初始敌我就是面对面，距离很近没有拉开距离调整装备的机会，因此应提高装备武器的携带数量以尽早抽出来进行装备。敌人似乎会紧盯SNAKE攻击，只要 SNAKE和VENUS两人在开始时一个向上一个向下分别移动，VENUS就会很容易地处于敌人身后进行背面攻击。同样是怎么打都能过，如果觉得被烧到很烦人的话，可以考虑装备ID374 ボムブラストスーツ+。
METAL GEAR KODOQUE（前代的METAL GEAR）：
两肩HP700
中间HP1800
前代最终BOSS，在前代中就不强，到了本作中依然如故，主要是行动规律性太强。
建议携带ID8 FIM-92B、ID297 FIM-92C、ID555 FIM-92A以及6格以上的远距离移动卡。
战斗要求300 COST内击毁KODOQUE，但时间其实很充足。战斗初始时KODOQUE全身没有攻击目标，会用范围很大威力小的激光进行攻击，在主角们接近之后将开始正式使用两肩的浮游炮攻击，此时攻击点就是两肩的浮游炮发射器，浮游炮发动10 COST后进行攻击，其间会在地面上显示着弹点（以着弹点为中心3*3的范围内是有效攻击范围），因此只要注意每次行动不要超过10 COST，就没有被打中的可能。当两肩被击毁后，KODOQUE会改用弯下腰后的头部光束炮攻击，光束炮发动20 COST后进行攻击，攻击范围为前方全范围，但攻击力不足以致命，躲不躲都行，或者用ID381 太陽バンク+硬扛，但要注意只有在KODOQUE弯下腰准备攻击时，中间的攻击目标才会出现。
CHAIGIDIEL（倒挂在屋顶的“庞统”）：
HP3000
已经是血厚的敌人了，打起来比较麻烦，主要是会使用让己方混乱的特技，基本上一个人被他施两次法就会混乱，要受到攻击才会恢复。
建议携带ID2 FAMAS/G1和ID519 AN94アバカン+的武器组合及弹药、ID236 転倒付加リンケージ或ID507 転倒付加リンケージ+（注意这两张卡的LINK条件不同）、ID381 太陽バンク+、HP回复品以及COST回复品。
初始位置敌我相距较远，可有1至2回合的装备时间。敌人一直在屋顶移动，这反而有利于绕到后面进行背面攻击，転倒付加リンケージ随武器射击发动时可以将敌人从屋顶打落，只是要注意LINK条件所要求的射程，或者直接装备ID1 SOCOM，但使用SOCOM的缺点是无论主动攻击还是援护攻击会使敌人一直向前转倒渐渐离开射程，需要随着攻击调整人物的位置。只要能够形成男女主角同时在敌人背后的情况，过关基本就是时间问题了。须注意的一点是敌人在失血到一定程度时会将整个战场变黑，此时一旦被敌人离开视线，将很难再抓到攻击机会。
VINCE（面具巨人警备部长）：
HP2000
初期主要装备：前闪*2
OICW警备兵*3：
HP400
初期主要装备：前闪*1
盾牌警备兵*3：
HP400
再战VINCE警备部长，VINCE本身并没太明显的提高，只是较少无用的威吓攻击而基本改为直接攻击而已，本关难点在于一起围攻过来的6个杂兵。相当困难、很需要运气的一关。
建议携带ID2 FAMAS/G1和ID519 AN94アバカン+的武器组合及弹药、ID101 太陽バンク和ID381 太陽バンク+（有多少带多少）、ID416 フォーチュン+、ID424 ジョニー佐々木+、ID423 オルガゴルルコビッチ+和ID514 ドロー3リンケージ+、ID245 ACTION+リンケージ和ID516 ACTION+リンケージ+、ID365 サバイバルキット+和ID366 救急箱+、6格以上的远距离移动卡、HP回复品以及COST回复品（多带）。
这一战中最危险的不是作为 BOSS的VINCE而是盾牌警备兵，由于其装备有转倒效果的手枪，被围攻上两次搞不好就是气绝，即使没被打成气绝，再进入行动回合时若手中没有能够进行补充的卡片，顾及到下回合再被攻击依然有气绝的危险，真正可用的卡片数量也就只有1、2张了，这无论对攻击或回复都会造成重大的影响，因此战斗中的最优先攻击目标是三个盾牌兵。战斗开始后如武器入手顺利就可在1回合中先集中将正面最近处的盾牌兵干掉，然后依VINCE的移动方向，在下一回合开始向敌人数量较少的弱侧移动，同时利用VENUS的默认3次行动加远距离移动卡，尽量让她移动到敌人背后较安全的区域，这样即使SNAKE被打至战斗不能，也能拖延时间使用救急箱+或等到SNAKE自动恢复。战斗中使用太陽バンク+提高抗打击能力和大量使用COST回复品减少被围攻的机率是重中之重，同时要善用フォーチュン+的20次子弹回避来对付盾牌兵的转倒攻击，只要能坚持到盾牌兵被全灭而手中又还能抽到太陽バンク，胜利就基本没问题了，最后剩一个VINCE用老办法就可以搞得定。
METAL GEAR：
两腕HP1500
中间激光枪HP1500
座仓HP1000
监视器HP2000
MG系列历代的重头戏对METAL GEAR战，似乎很多人说难打，而我觉得是相对较容易的一战，难度远不能和前一战对VINCE+杂兵相比。
建议携带ID8 FIM-92B、ID297 FIM-92C、ID555 FIM-92A（这三种要多带）、ID381 太陽バンク+、ID424 ジョニー佐々木+、6格以上的远距离移动卡、HP回复品以及COST回复品。
战斗最初METAL GEAR身上就会有两腕和中间激光枪三处攻击点，其主要攻击方式大体就是机枪横向数列扫射、激光枪纵向3列扫射、浮游炮随机着弹点攻击（注意和METAL GEAR KODOQUE的浮游炮不一样，没有等待时间，不能预判着弹点）、移动踩踏四种，其中前三种都没有致命的杀伤力，都要连中三次才会死，只要注意回复和使用太陽バンク+基本没什么威胁，唯一要注意的是移动踩踏带有即死效果，而且这种即死效果是用ID480 ウィリアムLフレミング的防即死也防不住的（废话，那么大家伙踩在身上，还跳着踩，什么东西也扛不住）。战斗开始后男女主角要分别往战场两侧跑，避开激光枪的射击范围，同时用FIM-92系列进行远程攻击（FIM-92系列的射程真赞，足够从战场一边打到另一边），攻击时注意先集中打两腕，留着中间的激光枪最后再打（只打纵向3列很容易避开），当两人向两边分别跑开后METAL GEAR会只追一个人，只要注意不要处于它可能会移动到的区域即可。当被METAL GEAR追到接近墙壁时，就直接跑去紧临墙壁站着，METAL GEAR由于占面积大，踩踏的攻击打不到墙边，这时墙边的饵只要注意补血，另一人站在远处不停地FIM-92就万事OK（注意中间的激光枪在背后等角度打不到），即便作饵的人不小心被打成战斗不能，等METAL GEAR蹭到另一人附近时，战斗不能的人也早醒过来了。
剧情过后进入战斗后半段，目标只有座仓一个，METAL GEAR的动作虽有变化，踩踏变了前冲，但攻击性质并没变，依然采用之前的战术即可，座仓被击破后会再追加一个监视器，一样是白送。
VENUS（女主角）：
HP2000
女主角会携带和你同样的卡片，血比你厚，行动次数比你多（这里作BOSS的VENUS可以使用正常任务中SNAKE专用的ID49 ACTION+和ID62 ACTION++，所以行动比你只多不少），普通格斗攻击比你狠，卡片组合用得还比你好........-__-b老实说吧，用正经的方法我觉得没得打，怎么都是死，带的卡片越强自己死得越快。无赖的太陽バンク+？表开玩笑了，如果你还打算赢她就不要想这张卡，绝对能让你亲身体验这张卡有多无赖。
当然有迅速而简单的打法，把VENUS引到战场右边没有挡板的悬崖边，用转倒性质的攻击把她打下去就行。不过个人认为这是投机取巧，并不是真正把她打赢的，用卡片对决把她搞定才算高手啊。
我想到的一种极慢的卡片对决打法：
敌人不会用TRAP卡，这是这种打法产生的基础。
携带卡片为ID496 テント+（能带多少带多少，其实只用得到1张，多带为了能尽早抽到）、3张ID350 サバイバルナイフ+（为加快速度而带，为不被打死而不能多带），其它空位全部带成各种移动卡，HP回复卡一张都不要带。
战斗开始后直接找个墙角自己站过去（因为普通格斗攻击有向左横向转倒效果，所以一定得是只有一面有路的死角），出了テント+之后在地上使用，然后和 VENUS开始“文打”，对拼普通格斗攻击，每回合双方各只能用一次，虽然VENUS的攻击比较狠一点，但仗着テント+每回合20%的HP回复量，可以保证只胜不败，只是每回合一次普通格斗的杀伤力太低，那3张サバイバルナイフ+纯是为加快速度的。
由敌人不会用TRAP卡这一点应该还能设计出其它较快的打法，但似乎仍旧是利用了对方的死角，不知道有没有人能想得出不利用死角硬拼取胜的方法？
