剧情过后去霍格海姆村找Neville，路上在一面镜子处需要玩一个连星座的游戏。游戏后按提示找到一座雕象，回到刚才玩星座游戏的地方使用魔法将其修补好。完成后继续去找Neville，在植物园帮Neville作草药学功课，（按提示载花，屏幕显示X几，就点那盆花几下），完成后发生剧情，回到公共休息室。
接下来要开始D.A的训练（注：D.A 邓布利多军）训练就是象进行决斗似的用魔法攻击。点击画面中央的书就开始了。完成后，去礼堂找Angelina，发现她被桌子困住，使用魔法解救之，之后去魁帝齐比赛休息室，用魔法清理干净屋子。完成后按提示来到门口，发现Malfoy，继续开打。胜利后是2个小游戏，一个是爬墙，另一个是走独木桥。都非常简单，按提示完成即可。然后去找Cho，帮助Cho把上面的东西拿下来。完成后回到公共休息室。之后继续参加D.A训练，训练结束后去图书馆做星象学作业（就是将下屏星座中缺少的东西按上屏给出的完整星座连起来），之后还要进行D.A训练。
训练完后Hermione跑过来说Hagrid回来了，去找Hagrid。路上在一画像处需要口令才能通过。于是去礼堂的书柜拿口令。出来后看见Malfoy3人组，开打。胜利后来到小屋，没有看见Hagrid，去森林找他。到森林后发现有翼兽，进行迷你游戏（分2部分，先是选择正确的食物喂它，再就是爱抚它。）照顾完后Hagrid跑了过来，让Harry去看他的弟弟巨人Grawp。看完后回来进行D.A训练，训练完后找Mcgonagall教授学习变形课。
变形课完后又是D.A训练，结束后去找Padma和Parvati，路上被一位同学拦住，于是先去医务室解决病床的问题，用魔法解决后来到医务室外面的雕像处，从那进入。到图书馆找到Padma和Parvati，做作业。（此游戏是从下屏中给出的几个图象中选出与上屏一样的来。）完成后，回到休息室。
继续D.A训练，训练结束后按提示找到1个雕像后用魔法点燃它。去找Mcgonagall教授继续学习变形课，之后去图书馆找到Hermione一起去配制魔药，配好后来到广场，看见Malfoy3人组，开打。胜利后来到图书馆找到Dean。完后继续D.A训练。训练结束后回到公共休息室看见Fred兄弟的广告。和Hermione去找他们。在礼堂门口找到他们后，回去继续配制魔药。配好后在广场又碰到了Malfoy3人组，打完后去长廊发现路被堵上。于是先从旁边走过去（找平衡游戏），过去后先用魔法将坏了的塑像修好，然后回去将堵路的东西用魔法移走。通过后，去Gryffinda校长的办公室，刚到门口又碰到Malfoy3人组，轻松解决后回宿舍拿Harry的荫身衣和活点地图。然后去Umbridge的办公室。到达地点后需要爬墙（一个小游戏，点触屏幕中出现的脚印即可），将东西顺利拿到手后，去找Fred兄弟，之后回来参加D.A训练。训练结束后发生剧情。
剧情过后要跟Snap教授学习大脑封闭术（迷你游戏，不要让Harry这边的蓝球出去，也不要让Snap教授的黄球过来。）学习完后发生剧情，回到了凤凰社总部。先跟教父Sirius对话，然后去照顾有翼兽。完成后发生剧情，继续去找学习大脑封闭术。路上碰到Malfoy的两个跟班，开打。胜利后找到Snap开始学习封闭术。学完后去找Hermione一起参加最后1次D.A训练。到原先的入口时发现有人，于是改道从医务室旁边的画像处进入。发生剧情，D.A总部被Umbridge发现。接着发生战斗。哈利以一敌三，此战必败。之后发生剧情，然后去找Hagrid。刚到Hagrid的小屋门口，又碰到Malfoy三人组。打败他们后回到休息室。
终于到O.W.L考试了，去礼堂参加。（O.W.L考试就是之前玩过的小游戏的集合）。考完试后找Snap教授继续学习大脑封闭术，学习完后和Hermione去礼堂参加O.W.L考试的第2场。考完后回到公共休息室。然后去找Fred兄弟，找到后去大楼外面，与Malfoy三人组发生战斗。胜利后爬上墙头去拿个箱子，使用魔法打开。之后回到礼堂，发生剧情。
剧情过后，Harry和他的一群伙伴来到了魔法部总部，去魔法资料室找到瓶子后，发现Voldemort的手下赶来，同时Harry的教父Sirius也及时赶到，开始了经典的五连战。在第4场战斗中，Harry的教父Sirius不幸被杀。五连战束，发生剧情。Dumbledore校长赶来。剧情过后是Dumbledore教授对战Voldemort，战斗胜利后需要与Voldemort进行大脑封闭术的对抗。至此，主线剧情到此结束，谢谢观赏。
