=返回城都篇攻略=
关东篇开始～
自家
从联盟回到家里，一下楼妈妈就告诉说空木博士找。
ワカバタウン若叶镇
到研究所，博士将从浅葱港开往枯叶港的船票ふねのチケット给了主角。
アサギシティ浅葱市
进入港口，居然看到大木博士，他祝贺你成为了新的冠军，并且将你的图鉴升级为全国图鉴。（这次条件真简单）并且交代说，如果来关东地区，一定要来真新镇看看。和大木博士告别后，就可以上船了。
アクアごう激流号
刚上船就被个老伯撞到，原来他是着急找自己的孙女。和某房间睡着的水手战斗后去下层，向右走后上梯子，进入船长室后就可以看到被怪爷爷船长勾引的小萝莉。但是小萝莉要跟你玩捉迷藏，在下层左侧找到她，回到1楼左上角房间找老伯，老伯作为答谢送个メタルコート钢铁外套。事件结束，船也到了枯叶港。
クチバシティ枯叶市
关东的徽章我门来了！不过出港的时候又和水君同学见面了（说实话我都忘了……）这次米那君倒是同时赶到，不过依然让水君给逃了。这里有最喜欢口袋妖怪俱乐部的房子，听会长啖坎后可以得到升级糖1颗。接下来去挑战会馆吧，此地的属性为电气系。机关同红绿版一样是连续开2个垃圾桶里的机关，开错就重来，运气不好就SL吧。胜利后获得徽章及TM34电击波。
馆主マチス马志士（感觉瘦了不少）
LV51雷丘
LV47三磁怪
LV47顽皮弹
LV53电击兽
LV47顽皮弹
6号道路
地鼠洞前有只巨大的卡比挡路无法前进，向上走吧，过了关口来到山吹市。
ヤマブキシティ山吹市
继续挑战道馆，这里的属性是超能系，机关还和红绿一样，只要一直走左边或者右边的传送板即可抵达馆主房间。娜姿大变样……胜利后获得徽章及TM48特性交换。另外公司大楼的警卫会送升级卡，3D龙用的。
馆主ナツメ娜姿
LV53光精灵
LV55胡蒂
LV53吸盘魔偶
8号道路
从山吹市右侧出城，经过8号道路来到紫苑镇。
シオンタウン紫苑镇
到原来鬼塔，现在的广播台里和乱跑的台长对话，得知广播台的电力没有了，帮他去发电所看看吧。
10号道路
从紫苑镇向上，经过10号道路，来到岩石隧道。
イワヤマトンネル岩石隧道
初代因为不会使用闪光而成为多少人噩梦的岩石隧道这次依然黑灯瞎火，开了闪光走吧，通过后抵达9号道路，之后走水路前往发电所。
はつでんしょ发电所
进入发电所后，和这里的人都打一遍招呼后得知这里前几天的设备刚被盗了。临走前警卫接到电话说是华兰市发现小偷的行踪。
ハナダシティ华兰市
走哪条路都可以，抵达华兰市后，本想先去挑战道馆，结果刚进去就被个火箭队的白痴撞个满怀，看来设备也是他偷的了。
24号道路&25号道路
追着小偷从24号道路到25号道路，小偷不见了，却遇到约会的小霞同学，约会的小霞没好气的说在会馆等着你。另外此处的房子里住的是正辉的老爹，给他看对应的PM能得到特定的进化石。
ハナダシティ华兰市
这次可以去挑战道馆了，和老版比变化还真大，不过没有啥特别的机关。小霞……我打赌她绝对整容了。胜利后获得徽章和TM03水之波动。
馆主カスミ小霞
LV49哥达鸭
LV49沼王
LV52乘龙
LV54宝石海星
24号道路
再次返回24号道路，又看到小偷，这次可不能放过他了，一场战斗后，他又跑了……不过和被他打扰的恋人们谈话得知，那家伙把什么东西藏在来道馆救生圈附近。回到道馆，调查上面靠右的救生圈（从上面）就能得到机械部品了。
はつでんしょ发电所
带着部品回答发电所，终于可以发电了。作为报答，得到了TM57充电光线。
シオンタウン紫苑镇
回到紫苑镇广播台，这里的广播也开始播出了，和台长对话，他将你的手表升级，可以接收到关东地区的广播了。
タマムシシティ玉虫市
返回山吹市向左走来到玉虫市，在这里的百货大楼可以看到白金里水系馆主马克西大叔，和他说话会送你白金三主角的面具，真是恶趣味。这里的道馆是草系，虽然没机关，但是路比较难找。胜利后获得徽章及TM19亿万吨吸收。
馆主エリカ莉佳
LV51毽子棉
LV56大食花
LV56美丽花
LV52蔓藤怪
ヤマブキシティ山吹市
山吹市某间特殊颜色的民居内，父母正在为女儿的玩偶丢了而着急，去枯叶市的最喜欢口袋妖怪俱乐部找中间的胖子就可以得到玩偶，出门的时候……哇靠，我没看错吧，居然是方圆地区的冠军大悟同学，他告诉主角，现在红水都（银魂也许是蓝色，未确认）正在关东地区出现……回去把玩偶交给那个女孩，作为答谢得到电车月票，之后就可以通过山吹市和小金市之间的新干线往返城都和关东了。
クチバシティ枯叶市
到原来卡比睡觉的地方，用十字键将手表中的收音机功能调至圆圈最上部的ポケモンのふえ频道，和卡比对话就能叫醒他，50级，收服还是打到随便了……
