かりのみずうみ愤怒湖
通过来到愤怒湖，这里有不少训练员，湖里的地图和旧版有些变化，需要绕绕。仔细看看，哇塞，湖中那个好闪的家伙是嘛？靠，是闪光的鲤鱼龙耶～赶快收服。当然你打算干掉他也没人反对……解决掉后获得红鳞片一块，可以拿去最开始见大木博士的房子那换取学习装置。回到右下岸边，看到那个黑披风男人，居然带着只快龙。他认为湖中之所以会出现闪光鲤鱼龙，是因为有人在捣鬼，想借助你的力量来查明这一切，并约好在乔基镇见面。
チョウジタウン乔基镇
返回乔基镇，在那个用树伪装的天线旁边的屋子里找到黑披风男，原来这里是火箭队的秘密基地，湖中之所以会出现变异的鲤鱼龙，是因为这里发出的奇怪信号所致。（这啥信号，告诉我吧，省得我天天用雷达连锁去）进入火箭队的秘密基地，这里的监视很严密，每次通过猫老大雕像都会引来巡逻人员2个，很是麻烦。棋盘阵那里每走几步都会出来会自爆的小拳石、瓦斯弹和雷电球，不过都是野生的，逃跑即可。走过去后的黄色传送点是回出口的，走左侧的楼梯下2楼，黑披风男也就是渡已经在这里等着你了，并且帮你恢复了精灵。继续前进到3楼，和渡对话得知火箭队现在将门全都锁起来了，需要拿到密码才能开启去BOSS房间的门，将此层的2个女性火箭队员战胜后对话即可获得2个密码。从右上的楼梯返回2楼，继续深入，在BOSS房间门口遇到对手红发男，一顿挑衅后他闪人了。用2个密码打开大门，进入BOSS的房间，靠这不是坂木么……当然不可能，其实是一名叫ラムダ的干部假扮的，打败他把。
ラムダ
LV22超音蝠
LV23瓦斯弹
LV24拉达
打败他后，他养的黑暗鸦告诉主角其他门的密码。跟着黑暗鸦一路小跑，来到奇怪装置的门口，此时出现火箭队干部アテナ和小杂兵一名，不要怕，因为渡也会来帮忙。终于和渡组队了，泪流满面啊。在渡同学40级肥大（误）的威力下轻松打发掉2名火箭队的同学。解决后火箭队全员撤退，这里面的装置看来就是发射奇怪电波的机器，和渡分头解决6只供电的顽皮弹后搞定。（话说这装置能打包带走么……）作为感谢渡送给了我们HM05漩涡。
解决掉火箭队后就可以去挑战道馆了，这里道馆是冰属性的。机关是靠推冰块外加滑行前进，推错了话，重进房间即可更新。第一个房间直接走，第二个房间从左边走把左边的冰块推到右边后向上走，第三个房间先将左边的冰块向右推，然后按上右下左上右上右上左上的顺序即可到馆主前。战胜后获得徽章及TM07冰雹。
馆主ヤナギ古柳
LV30小海狮
LV32白海狮
LV34长毛猪
刚出会馆门就接到空木博士的电话，说是小金市的广播台被火箭队入侵了，赶紧去看看吧。
コガネシティ小金市
这里的街道已经被火箭队封锁了，不能走正门进入广播台，去地下通道看看，这里有个家伙会给你化妆成火箭队成员的模样，于是这样就可以混入广播台了。不过在就要成功的一刻，对手红发男突然跑来，认出了主角……看来只好把看门的火箭队成员干掉了。爬到顶层找到台长，可惜不是真的，还是地下基地那个ラムダ假扮的，他的水平还是和以前一样的菜，击败后获得地下通道的钥匙，真正的局长被关在那里。
再次进入地下通道见到舞姬小姐，继续前进用钥匙开门进入地下室。刚进去，对手红发男追了上来，这次看来是要开打了。
对手
LV30大嘴蝠
LV32纽拉
LV32主角精灵最终进化型
LV28小磁怪
LV30鬼斯通
战胜对手后，按照蓝红绿的顺序调查机关即可打开大门进百货大楼地下仓库，这里关着真正的局长，解救他后获得钥匙卡。返回广播台3楼用钥匙卡开门上楼，路上要分别跟火箭队的另外2名干部ランス和アテナ战斗，之后坐电梯到BOSS的房间。终于要面对火箭队的幕后老大アポロ了。长的好像银河团老大……难道是他弟么……
火箭队BOSS
LV35戴卢比
LV35瓦斯弹
LV38地狱犬
一番恶战后老大终于撤退了，这时局长出来感谢我们的英勇行为，并将にじいろのはね七彩羽毛送给了主角，有了这个就可以去铃塔召唤凤凰了。
44号道路
返回乔基镇后就可以向右前进来到44号道路了，通过后进入冰之通路。
こおりのぬけみち冰之通路
这里又有人给拍照了……不知道干什么用的。这里的谜题比较麻烦，第一个冰面的走法是上左上左下左上右。之后的冰面是右上左下左上右，取得HM07攀瀑布。拿到后进入2楼，这里的谜题和老版一样，将石头推到洞里。之后下到3楼，从梯子那个地面左上角往下数第2格的地方开始，按左下左上右的走法即可抵达楼梯。之后上楼，某个精灵球的拿法是要先从上面通过后，再把石头往回推。之后的冰面又遇到舞姬小姐，然后就出洞了，来到烟墨市。
