第十五章 ほしのていしのしんじつ（星之停止的真相）
原来传说中控制时间的精灵——ディアルガ才（钻石兽）是这一切的真正的幕后指示者！从次元之洞而来的它被称为“暗黑的ディアルガ”，就是它使得未来的世界变成了星之停止的暗黑世界，而草蜥蜴为了从历史上改变这一切而前往过去的世界，而时之齿轮是破坏星之停止的必要物品，因为时之齿轮能够使次元之洞恢复原样，这样一切都可以改变了。但是……曾经尊敬的夜游神竟然是……草蜥蜴先出发了，他告诉主角他们，如果要让时间恢复，就要找到雪拉比。好吧，为了将来，先去探险吧，不过，我们一定要回到以前的世界！跟着草蜥蜴来到新的迷宫くろのもり（黑森林），据说这里有穿越时间的精灵，也许就是雪拉比！进入吧！在森林入口处，主角果然又感觉到了什么……这似乎就是当初在现实世界里远征时到过的营地？！三人身后，宝石眼追上来了……
くろのもり（黑森林）8F
道具：钱，玉，苹果，
BOSS：无
出现精灵：毽子棉，蓑叶蛾，梦魇，地龙，
突破要点：迷宫比较大，虽然房间并不多但是路也比较乱；梦魇会穿墙.
到达森林最深处，不过雪拉比却没有出现……难道被暗黑ディアルガ抓走了？“谁被抓走了？”淘气的雪拉比现身了～原来它竟然和草蜥蜴相互认识！正当几人要出发时，雪拉比突然发现了什么似的指着主角——啊，你是——！啊，没什么～他是不是故意的……雪拉比带着三人来到了时间回廊前，这次要和草蜥蜴还有雪拉比一起穿越时间的迷宫了
もりのたかだい（森林高台）12F
道具：金钱，技能训练机，玉
BOSS：无
出现精灵：草精灵，大钢蛇，钢甲，六尾，铁甲暴龙，沙暴河马，
突破要点：这里的精灵的防御普遍很高，迷宫的结构并不复杂；注意保护好草蜥蜴和雪拉比；铁甲暴龙的投石是连续攻击杀伤力很大
终于来到了时之回廊，但是正当他们要进入时，突然一个声音响起，真是久违了！这个声音是！果然，夜游神出现在四人面前，还有他的一群宝石眼手下……就在这时，暗黑ディアルガ才终于现身了！看到眼前的景象，草蜥蜴反而……反而……放弃了……他似乎知道，对于黑暗ディアルガ才来说，一切都是无用的……这时，草蜥蜴终于说出了另外一个让人震惊的事实——其实当初和他一起返回过去的世界的还有一个同伴！但是在时空为回廊里走散了，为了粉碎星之停止，为了让未来恢复，拜托主角们再去寻找他的同伴！但是，就在主角的名字被草蜥蜴大声说出，那就是他的同伴时，主角震惊了。原来他就是草蜥蜴的同伴？！一个曾经是人类、现在却是精灵的同伴？！原来夜游神早就知道了这一切，在过去的世界中一次次的探听，终于让他知道了原来主角就是草蜥蜴曾经的人类同伴！难道真的一切到此为止了吗……可是搭档却求雪拉比稍微进行一下时间转移，有什么打算吗？雪拉比的时间控制很快就被暗黑ディアルガ打破了，在雪拉比的催促下，三人匆匆进入了时空回廊，而聪明的雪拉比也在转眼间消失了……
第十六章 よあけのおもい（黎明的希望）
醒来的主角发现自己正躺在沙滩旁（好……好熟悉的场景……只不过身边又多了两个……）终于回来了！！！赶快先回去行会看看吧～不过草蜥蜴似乎不太适合这里……搭档带着他来到村头的鲨鱼岩处，原来这里是他在进入行会前做的秘密基地！今晚就在这里渡过吧～晚上，三人谈起了关于草蜥蜴和主角的事情，二人在未来查找到时之齿轮的线索，回到过去寻找，时空中的事故，变成精灵的人类，还有——消失的记忆……
天还没亮，草蜥蜴却发现搭档不在床上，来到地面一看，原来他在看着远方的星空想着自己的事情。看着升起的朝阳，草蜥蜴终于向搭档说出了感谢，感谢那时只有他没有放弃……搭档却说，这来自于对同伴的信任啊～是主角给了他勇气的力量。
天亮了，开始这个世界的冒险旅途，第一目标是时间静止的キザキのもり！
キザキのもり（木崎森林）20F
道具：种子，果实，玉，
BOSS：无
出现精灵：地狱犬，超能少女，樱花兽，勇吉拉，女皇蜂，九尾，
突破要点：地狱犬的围攻要注意；勇吉拉如果在睡觉最好不要招惹；女皇蜂的压力特性是削减PP的。
但是来到底层，并没有看到被放回原处的时之齿轮，时间还是静止的，这是怎么回事？难道圣菇说了谎？但是时之齿轮确实还在这里，为什么？草蜥蜴取下了时之齿轮，并让搭档回到宝物镇打听一下现在的情报。当三人回到住处时，搭档却带来了不好的消息，看来次元之洞已经开始发生了……需要尽快了，下一个目标进发！不过，在那之前，的确还有想要去的地方啊“プクリンのギルドにいこう”，当然他们会相信主角的吧“しんじてくれる”，因为，大家的力量是必要的！
