战斗结束后，加罗修提议到他的故乡艾洛村休息一下。如果先前在萨拉班多买了束鲜花的话，在该村中就可以将它送给桥边的女孩，来换取遗迹地图。另外，一间民房旁猪圈中有三头小猪，和它们对话后就会跟着米狄奥走，过桥时那三头小猪发现一个蛋，拿着蛋回本阵给母鸡孵，便又得到一只幻兽“盼羔”（ペンコ）。与辛比奥斯军那只“盼”一样，雌性的盼羔亦是个毫无是处的角色，难道在第三剧本中这两个小家伙会养出只超强的传说之生物吗？多米尼特皇帝在酒吧中，还假惺惺对米狄奥说因为他救皇帝有功，所以特别准许战争结束后让他与母亲美玲达相见。
战役25
补给完毕后，米狄奥军进入山洞中，打算穿过此地经斯瓦普兰德领至阿斯皮亚。一如捷多所言，达卡和萨伊奥斯早就在洞中等候着众人。洞中有个遗迹，将南面的敌人收拾掉后再去遗迹也不迟。遗迹入口处有一按钮，踏上按钮就可以开启各道石门，因此可以充分利用这一优势将盗贼困在两道石门中，然后赶过去收拾他。多米尼特皇帝那群NPC皆攻击力不俗、防御力低下，需要照看好他们，基本上要让他们走在米狄奥军的中央。最后，处于前方的达卡战死，萨伊奥斯见大势已去连忙跪地求饶。多米尼特皇帝却不肯放过他，因为在二十年前贝内特雷姆和高姆拉德发动建立共和国的独立战争时，皇帝派遣了同是皇族的萨伊奥斯和达卡前去讨伐，然而这两人却帮助贝内特雷姆建立了共和国，之后他们就得到了自治领主的地位。但是，远离帝国那豪华的生活，达卡与萨伊奥斯均心有不甘，所以现在再度和古拉比串通，试图推翻多米尼特回到帝都去。多米尼特皇帝不顾萨伊奥斯的求饶，要米狄奥动手杀他。米狄奥自然不肯对一个已经没有抵抗能力的人动手，拒绝了父王的命令。最后皇帝让潜伏在洞口的忍者亚夏将萨伊奥斯处决，他还冷笑着对米狄奥说：“你是怎样一个人，我现在已经很了解了。”众人方醒悟皇帝是有意试探米狄奥，不禁皆打了个寒颤。
第六章 多米尼特皇帝的野望
米狄奥军守护着多米尼特皇帝来到斯瓦普兰德领，失去领主的士兵们自然无意再战，于是帝国轻松地占领了该地。多米尼特皇帝进城后所做的第一件事，就是下令处死萨伊奥斯的妻子伊莉娅（イリア）及其子女。米狄奥坚决反对，多米尼特皇帝一怒之下几乎要连他一起处罚，所幸费迪利提来打圆场提示皇帝：如果现在处罚王子的话，会使军心动摇。再加上军师古兰达克委婉的交涉，多米尼特皇帝终于同意将处刑推迟。米狄奥出得领主馆，作好出发准备后，由领主馆底楼出城。
战役26
在斯瓦普兰德大湿原上，众人又遇到了芭桑妲祭司。她的儿子布拉夫（ブラ－フ）刚刚败在辛比奥斯军手下，芭桑妲正一肚子气没出发，见到米狄奥自然就迁怒于他了。大湿原上到处都是一个个小水潭，行军比较不便。同样地，我军可以分为西、北两路进军。至于皇帝一行则不用去理睬，他们自会很谨慎地移动。敌首领是布尔扎姆教魔法师以及瓦姆女王（ワ－ム），先干掉魔法师比较妥当。
战役27
米狄奥军平安地渡过大湿原来到火山，但是阴魂不散的布尔扎姆教徒又出现了。此时众人发觉火山正处于极不稳定的状态，据布尔扎姆教徒所言，那是因为先前辛比奥斯军路过此地时杀死了小龙，现在龙妈妈正在火头上。这一版地形限制得很厉害，因为有几处通道时升时降（每回合一开始就变动一次），所以行军时一定要注意，有时即便等上一、两个回合，也不要让队伍被分断开来。行至地图三分之二时，龙就会出现。
战斗结束后，皇帝见布尔扎姆教连龙都能操纵，便问米狄奥是否依然坚持要回帝都？无论回答是否，都会被皇帝冷嘲热讽一通，最后他又推脱还是先出火山再说。来到平原上，布尔扎姆教徒正想发动总攻时，有教徒前来传达狄丝赫玲的命令要他们终止攻击。待其走后，皇帝招来亚夏询问其原因。原来亚罗卡特王子的计划彻底失败了，布尔扎姆教操纵的古代巨神战士被毁、第二王子被杀、用来作为人质要挟共和国军的马罗利领主（マロリ－）特拉斯汀（トラスティン）的儿子阿古利德（アグリ－ド）被救，这些杰作皆辛比奥斯军所为。至于古拉比总督则逃到斯特利齐村（ストリッヂ），打算重整军势。
于是，在皇帝的强烈要求下，米狄奥军来到了斯特利齐。在本阵中，大家商讨米狄奥的处境，开始对多米尼特皇帝产生怀疑。根据种种迹象表明，忍者亚夏和军师费迪利提都是皇帝故意安插到亚罗卡特王子身边的，那么第二王子策划绑架他的计划皇帝应该不会不知道。难不成多米尼特皇帝明知亚罗卡特的计划，却故意将计就计，借此来名正言顺地侵略共和国吗？军师古兰达克忙制止众人再度猜想下去，他认为没有证据的情况下，凭空怀疑皇帝势必令米狄奥的处境更加困难。走出本阵在村中逛悠一圈，酒馆中有一名叫帕佩茨（パペッツ）的女孩，她说是其师父占卜出这个世界需要米狄奥，所以派她来保护王子的。帕佩茨的职业是魔物使，能够操纵怪物们，是位不可缺少的好伙伴。到独立区的五星级宾馆的二楼谒见皇帝，多米尼特皇帝刚开口讨论如何进军共和国首都阿斯皮亚，就被古兰达克急忙打断。古兰达克向皇帝声明，米狄奥军中大多数人皆非帝国臣民、甚至还有共和国战士存在，如果强要米狄奥军攻打阿斯皮亚的话，势必会发生叛乱。皇帝见米狄奥点头同意古兰达克的进言，便说他原本就没打算让米狄奥去进攻共和国。因为他认为害死亚罗卡特的罪魁祸首乃古拉比总督，所以要米狄奥去讨伐躲在物资储藏库的地下遗迹中的古拉比，替亚罗卡特王子报仇。这个差事米狄奥他们倒是比较乐于接受的，准备好行装后就往独立区内物资储藏库的地下遗迹进发。
战役28
在地下室，众人看到狄丝赫玲与古拉比总督正准备将挖掘出来的古代巨大战车移到外面去。如果古拉比用这无敌的战车去攻打阿斯皮亚的话，后果不堪设想。为了好友辛比奥斯的安危，米狄奥军决定奋力阻止战车的开动。在这一关中亦有个奈落遗迹，拿到地图的话就可以入内寻宝。至于狄丝赫玲一直站在战车前不会移动，所以用不着担心。但当我军接近她的本队时，需特别注意一定要先解决狄丝赫玲身边的四个魔法师，否则会造成惨重的损失。
虽然再度击败了狄丝赫玲，但来不及阻止古拉比总督开动战车前往阿斯皮亚。众人正在考虑如何处置倒在地上的狄丝赫玲，突然出现一个名叫简（ジェ－ン）的女子。简自称是“北国之者”，并非布尔扎姆教徒，但她却是狄丝赫玲的妹妹，且从其身上散发出与休多鲁的加尔姆等同的力量。因为感觉到简的强大力量，再加上不愿对一个受伤的人下手，米狄奥便同意让简带着狄丝赫玲离去（卖个人情也好）。接下来就要好好考虑如何阻止战车了，军师古兰达克突然说他想出了“一世一代の名案”，于是众人回本阵聆听他这一身一世中最好的主意。古兰达克认为要阻止战车，只能从内部去破坏；要派人潜入内部，也只有让米狄奥作为诱饵从正面吸引战车的注意力。虽然大家都觉得这个作战太过于危险，但也想不出更好的主意。至于第2军的指挥官，众人一致推举达比德来担任。此时，多米尼特皇帝居然走进来，夸奖古兰达克一番，还对米狄奥说他拥有一班好部下。
在正式作战前还需好好准备一番。首先将武器和防具锻造好，然后去地下遗迹练级、招收魔物、夺取米狄奥的最终兵器。和第一剧本一样，因为要分两队作战，所以人手缺少的第2军需要再补充三个人，这就要利用魔物使帕佩茨的力量。在物资储藏库的地下室，战车开出去的地方有地下遗迹的入口。地下遗迹一共有8层，每层只要打倒BOSS即可过版，且里面的怪物会源源不断地出现。帕佩茨给予怪物致命的一击后，该怪物就会请求加入队伍，受名额限制只能招收三个怪物，因此建议各位到最下面几层去招收厉害的怪物。（推荐招收第6层的BOSS瓦姆女王、第7层的龙、第8层的飞鸟。）第8层的BOSS有HP1000左右，击败他后可以得到米狄奥的最终兵刃以及能召唤雷神的法杖。一切准备就绪后，就可以出发前往阿斯皮亚了（一定要将帕佩茨编入第2军，否则招进来的怪物们就毫无用武之地了）。
战役29
战车此时已经逼近阿斯皮亚城，奇怪的是共和国军居然一点反应都没有，或许是看到如此巨大的战车而不敢出击吧？米狄奥率领第1军在阿斯皮亚城门前拦住战车，乘着他和古拉比总督对话之际，达比德悄悄地带着第2军从后面潜入战车内。一分为二的战役就此展开，第1军在城门前迎击源源不断出现的萨拉班多军，第2军则在战车内与古拉比总督对决。古拉比会在第2军行至中央台阶时变身成HP320的怪物，可以不用去理睬周围其他敌人，一门心思对付古拉比即可。危险时不妨用那三个怪物做挡箭牌，吸引敌人的攻击。
将古拉比击倒后，战车亦停了下来，外面那些萨拉班多军见大势已去纷纷逃迤。在战车内，达比德刚想上前了结古拉比性命时，忍者亚夏竟然出现并护住古拉比！在亚夏的帮助下，古拉比启动战车的大炮，本已破裂的大炮爆炸开来，整个战车灰飞烟灭，将阿斯皮亚那号称“难攻不落”的城墙炸出一个大洞来。硝烟过后，米狄奥悠悠醒转，发现第1军皆安然无恙，但第2军则下落不明。就在这时，元巴兰多领主提拉尼率领手下出现，指责米狄奥军侵略共和国王都。忍者亚夏再度出现在提拉尼身边，证实米狄奥军利用战车炮击阿斯皮亚城。米狄奥方醒悟这一切都是皇帝的计谋，诱使自己攻陷阿斯皮亚城。更糟糕的事情接踵而来，闻讯赶来的辛比奥斯第2军目睹这一情况，亦认为米狄奥背叛了辛比奥斯的友情，立刻拔刀相向，一场残酷的战斗开始了。
