（注：此次如果海盗声望比他少，就会让你去打奥斯曼帝国舰队，你去休达港酒吧安娜处打听消息，得知旅店里的地图画家洛佩斯（II中的海上学者）可能知道奥斯曼帝国舰队所在。见到洛佩斯后，得知奥斯曼帝国舰队在阿尔金岛。在领取命令的两个月后在阿尔金岛洋面遭遇奥斯曼帝国舰队，歼灭奥斯曼帝国舰队后，去休达港安娜处，再去海盗总部。从海盗总部出来后，在码头遇见比戈尔他会让你去新大陆打卡特琳娜（II中的女海盗）。在开云港外，与卡特琳娜遭遇。之后，霍勒斯告诉回地中海）
６、火药之旅
Where:长安港
When:17000
Who:夏尔克、沃尔夫、加斯巴尔、王秀迅
How :1、在某港霍勒斯提醒萨尔瓦多该回阿尔及尔看看了。
2、在海盗本部偷听到谈话后于凌晨2—4点出港。
3、在尼科西亚向夏尔克发起攻击。
4、败退后前往汉堡。
5、在汕头按酒店、道具店、出港所的顺序打听火药的所在。
6、在日本的界找到加斯巴尔。
7、在长安被王秀迅逮住，在被加斯巴尔救出后展开强制舰队战，不输即可。
8、回到汉堡。
Wny :海勒丁和艾尔谈到是和夏尔克决战时的人选问题，萨尔瓦多被指派的任务是到汉堡去干些什么。这使年轻气盛的主角相当不满，于是在里渥诺的怂恿之下，萨尔瓦多直奔尼科西亚而去，但令人吃惊的是奥斯曼帝国的舰队也在这儿，并且敌方的炮火超乎想像的厉害，无奈的萨尔瓦多没脸回阿尔及尔，只好按父亲话里提到的到汉堡去碰碰运气，原来沃尔夫博士一直在海勒丁的委托和赞助之下进行新式大炮的开发工作，但现在却苦于没有好的火药。于是游戏的舞台第一次离开欧洲，移到了火药的故乡——中国。时值明朝，闭关锁国国策已定，因此王秀迅才大言不愧的要把所有的外国人扔到黄河喂鱼，并高傲的把主角一行人称为野蛮人。（相信如果不是这样的话，推动那大航海时代的应该是中国）。
（注：在来的路上，遇到了英国海军奥托先生，在泉州按酒店、道具店、出港所的顺序打听火药的所在，在日本的界找到加斯巴尔后，有可能是在长崎被长谷平藏逮住，在被加巴尔救出后展开强制舰队战，胜利后得到青龙偃月刀和高效火药）。
Where:尼科西亚
When:21000
Who:何塞、艾丝美拉尔达
How :1、在汉堡等待一个月后博士开发出了新式大炮（之后就可以装备重加农炮）。
2、回到阿尔及尔参加战前会议。
3、潜入尼科西亚。
4、在尼科西亚被夏尔克发现，在瑞贝卡掩护下出港，固定战斗。
5、战斗后向霍棵斯追问自己母亲的事。
6、回到阿尔及尔寻找父亲，展开固定情节，战斗中必须取胜。
Wny :在军事会议上约卡和多戈被指派主攻任务，而萨尔瓦多则潜入尼科西亚放火制造混乱。此后再合流消灭夏尔克，但主角一行三人同时在尼科西亚遇险，里渥诺抢先一步逃出去向海上的约卡和多戈求救。
在前来取夏尔克性命的瑞贝卡制造的混乱中，萨尔瓦多和霍勒斯也逃了出来。但奇怪的是约卡和多戈的舰队却不见踪影。这时夏尔克得意洋洋的出现了。原来里渥诺的求救正好中了夏尔克的圈套，前来救助的约卡和多戈舰队遭到了伏击而被全歼，萨尔瓦多只好全力一搏。夏尔克临死前发出了“艾丝美拉尔达，他为什么一点都不像你呢？”这样的悲叹，萨尔瓦多对于夏尔克提到自己的母亲感到困惑不已。逼问之下，霍勒斯才讲出了十几年前发生的事，那时夏尔克还是海勒丁的部下，海勒丁一向对于手下的管理相当严酷。一次，一个海盗为了给妻子治病而私藏了一部分财物，在妻子也就是萨尔瓦多的母亲的苦苦求情声中，海勒丁还是杀死了那名部下。艾丝美拉尔达忍受不了残酷的丈夫，于是在当晚就和善良的仆人何塞一起离开了阿尔及尔，过起了隐居的生活。
不久，夏尔克也离开了海勒丁。在海勒丁的极力搜寻下，艾丝美拉尔达很快被找到，于是就发生了游戏刚开始时发生的那一幕。得知真相的萨尔瓦多兴冲冲地冲回阿尔及尔，却遭到了约卡的暗算，原来约卡将此视为排除竞争对手的一个绝佳的机会，把自己落入夏尔克圈套说成是萨尔瓦多的出卖所致，海勒丁自己心中也有鬼，于是萨尔瓦多就真的被“包装”成了叛徒，所辛萨尔瓦多再次遇见了米兰达！我们的主人公有一次回到了阿尔及尔……
８、哀伤的重逢
Where:斯德哥尔摩
When:30000
Who:里渥诺
How :1、在打败一名海盗后获得传说之铠的情报。
2、在那布勒斯找到教授。
3、到休达港酒吧获得珍稀动物的情报。
4、在马达加斯加岛附近找到渡渡鸟（Ｓ20，Ｅ50）。
5、回到布勒斯获得地图，指示地上为卑尔根，出港后固定战斗。
6、在卑尔根的旅店与大娘多次交谈后可以获得“恶龙之鳞”。
7、回那布勒斯见教授，再去波尔多。
