回到据点，把亚妮拉丝带上，经过琥耀之门进入下一个地点——湖畔研究所。这次的地图与SC的研究所正好是镜像分布的。进入建筑之后马上进入强制战斗，敌人反射魔法攻击。这次的建筑同样有三个卡片，用特定的卡片会打开特定的门。继续前进到1F深处进行第一场BOSS战，注意防止气绝即可。2F终点的对手是卡露娜，同样要防止气绝。3F对手是克鲁茨，注意回复即可。三战后获得三个卡片，这时出发把所有的验证门都打开吧。下面的对手很强大，建议所有参战队员等级都升到120级。这名BOSS是雾香，如果有肉搏系队员尽量冲上去跟她贴身近战，同时注意回复。雾香的S技伤害相当惊人，被攻击后必须立刻回复。
【星之门10】镜中秘所二层就有这个门，主角是玲，进入后有剧情战，敌人会毒、石化、黑暗。胜利后会看到帕蒂尔·玛蒂尔的调查报告，奖励10000mira，此后带着玲回到据点之后就会发生剧情，玲学会新的S技帕蒂尔玛蒂尔。
【星之门11】在镜中秘所一层，进入后有战斗敌人会反射魔法，死亡时自爆，最好的办法是用全屏S技直接解决。之后会看到关于怪盗B的调查报告。奖励10000mira和饰品怪盗斗篷。
镜中秘所的宝箱里能够拿到一个“里·武术大会参加许可证”，这个是进入太阳之门③困难难度的凭证。
【太阳之门③ 里·武术大会】（困难难度）还是三连战，现在可以不带金就能进入了，所以组建自己的最强的队伍来挑战吧。胜利后获得10000mira和灵之理（回路，装备者受到的魔法攻击伤害减少，物理攻击伤害增加）。
☆从琥耀之门解放到第七话进入礼拜堂，任意时间在大树下的书架会获得三本难懂的书（实录·百日战役、卢安经济史、结晶光学论文集）☆
第三部分-铁壁要塞
回据点把理查德带上。在周游道打开红耀之门，进入雷斯顿要塞。要塞目前只能进入研究楼内，刚一进入就要跟希德中校作战。希德在SC已经跟我方对战过了，此次再来，貌似还是没有太大进步，虽然物理攻击力很高，但是驱动大魔法的时间仍然很长，注意打断，一定不能让他放出全屏魔法。此战注意防冻结。
战斗后拿到兵营钥匙，进入兵营。兵营内有全游戏唯一一个魔兽宝箱，拿到B-01钥匙。接着前往南边跟凯诺娜作战，此战特务兵的威胁很大，建议优先清除。战斗后获得司令部钥匙，进入司令部。司令部1F有星门12，正好理查德在队，直接进去即可。
【星之门12】讲的是理查德离开军队之后在卢安的一段故事。奖励10000mira和回路谍报。
图中的两个钥匙是继续前进必须的道具，一定要先拿到。2F终点有石碑，继续前进发生BOSS战，对手摩尔根将军。摩尔根将军攻击带气绝，一定要注意。此战可以使用时间加速·改和时间减速，可以有效提高战斗效率。
战斗胜利后就可以继续前进了。玩家大概也能猜到下一个对手是谁了，注意必须让参战队员的等级达到120，并且调整好装备和回路，下一个对手不会使用异常状态攻击。
BOSS战对手是卡西乌斯单枪匹马作战，每一名可控角色都和他有着或多或少的联系，因此可以带不同的队员来跟卡西乌斯看到不同的对话。卡西乌斯的普通攻击就有很高的伤害，S技与其它战技也都有着恐怖的实力，因此这场战斗开始阶段建议用星杯领域防守，后面专门一个队员负责补墙，让理查德担任主力，连续使用光鬼斩就能比较容易的获胜了。战斗后不要着急离开，雷斯顿要塞的飞艇坪现在可以进入了，里面有宝贵的回复CP饰品——超斗魂腰带和超斗魂扎头巾。
第四部分-黑色方舟
回到据点把约修亚加入队伍，前往艾尔贝周游道开启最后一个门——黑曜之门，就来到了古罗力亚斯。按照图中A-B-C-D-E的顺序走，注意收集沿途的宝箱和调查星门13、太阳之门⑤，到了C点先去救基尔巴特拿到最新的安全卡片之后再前往机库。机库内发生BOSS战，敌方会用黑暗状态的攻击，注意防御。战斗胜利后乔斯特的S技“山猫号”会得到强化（无论她是否在队都能强化。之前如果没通过太阳之门①学会山猫号的话这里会直接学会山猫号II）。继续前进将会同时面对三位执行者，做好准备吧。首要防止的异常状态是气绝。
三位执行者作战方法不一样，建议先打会多种异常状态攻击的布鲁布兰，再打会用回复魔法的露西奥拉，最后解决瓦鲁特，注意每个敌人都会S技（开场最好放星杯领域，瓦鲁特第一次出手就会使用S技），因此一顶要注意随时回复。由于部分队员跟三位执行者有着很深的关系，科洛丝、奥利维尔、金、雪拉扎德在队会有不同的对话。战斗后进过传送阵进入第六话BOSS战，请做好防护气绝、冻结、混乱的准备。黑骑士战斗方法跟FC和SC的莱维区别不大，建议先打死旁边的D·幻影，之后再跟黑骑士和分身（最多两个）作战。唯一需要注意的就是不要让驱动中的回复被打断。没必要攻击分身，分身即使打死了也会继续召唤，因此只需要全力攻击本体即可。战斗胜利后传送阵变成了星门14（目前进不去）。艾尔贝离宫的结界解除。第六话结束。
